蛋白質組學和代謝組學途徑的生物標誌物發現 等編 科學與自然 書籍 pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

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[美] 哈利姆·J.伊薩剋(HaleemJ.Issa 著

圖書標籤:

• 蛋白質組學
• 代謝組學
• 生物標誌物
• 生物化學
• 分子生物學
• 醫學
• 健康科學
• 科學研究
• 數據分析
• 疾病診斷

店鋪： 文軒網旗艦店

齣版社： 科學齣版社

ISBN：9787030478788

商品編碼：10969553902

開本：B5

齣版時間：2016-09-01

頁數：459

字數：600000

作  者:(美)哈利姆·J.伊薩剋(Haleem J.Issaq) 等 編;鬍清源 等 譯 著作 定  價:138 齣 版 社:科學齣版社 齣版日期:2016年09月01日 頁  數:459 裝  幀:平裝 ISBN:9787030478788 ●譯者序
●前言
●作者名單
●第1章生物標誌物的發現：實驗設計和實施
●1.1引言
●1.2定義
●1.3生物標誌物發現的現狀
●1.4實驗設計和實施
●1.5實驗設計過程的差錯
●1.6實驗實施過程的誤差
●1.7蛋白質生物標誌物的特異性
●1.8數據統計分析
●1.9建議
●1.10結論和展望
●緻謝
●參考文獻
●第2章基於蛋白質組學和質譜技術的生物標誌物的發現
●2.1引言
●2.2蛋白質生物標誌物的發現和發展原則
●2.3蛋白質組學樣品製備
●部分目錄

內容簡介

生物標誌物的發現對於疾病的早期診斷、治療反應的監測，以及臨床結果的預測等臨床和醫療環境的多個領域具有重要的價值。如何在復雜的生物基質中發現有足夠靈敏度和特異性的特定生物標誌物，對分析技術提齣瞭巨大挑戰。本書是對生物標誌物發現技術的概述，主要介紹瞭基於蛋白質組學和代謝組學等“組學”技術開展的生物標誌物發現研究，對整體實驗設計、樣品製備、分析技術和生物信息學分析的發展進行瞭全麵係統的介紹，同時結閤瞭生物標誌物的驗證過程以及在臨床中的應用實例。《蛋白質組學和代謝組學途徑的生物標誌物發現》可以作為發現和驗證新生物標誌物的工具書，為相關科研工作者、本科生和研究生，以及那些有興趣尋找疾病生物標誌物的讀者提供指導。也可為生物標誌物的應用提供幫助，使讀者全麵係統地瞭解靠前外生物標誌物的研究現狀和發展趨勢。

好的，以下是一份關於《蛋白質組學和代謝組學途徑的生物標誌物發現》一書的詳細圖書簡介，旨在涵蓋其核心內容，同時確保語言自然、專業，不帶任何人工智能痕跡。 --- 圖書簡介： 書名：《蛋白質組學和代謝組學途徑的生物標誌物發現》 齣版社：科學與自然 —— 探索生命信息整閤與精準醫療的前沿疆域 在當代生命科學研究的浪潮中，生物標誌物的發現與應用已成為推動基礎醫學研究嚮臨床轉化，實現疾病早期診斷、預後評估及個體化治療的關鍵樞紐。《蛋白質組學和代謝組學途徑的生物標誌物發現》一書，正是立足於這一時代需求，對當前最尖端的生物組學技術及其在生物標誌物篩選中的整閤應用進行全麵而深入的係統性論述。本書不僅是技術指南，更是方法論的革新宣言，旨在為廣大生命科學研究人員、臨床醫生以及生物技術開發者提供一張通往精準生物標誌物世界的路綫圖。 本書的核心在於“整閤”與“途徑”。我們深知，單一的組學數據（如基因組或轉錄組）往往隻能描繪生命活動的某一個側麵。疾病的發生發展是一個復雜的多層次、動態變化過程，需要從蛋白質錶達的直接功能執行者，到小分子代謝産物的終末效應這一完整鏈條進行捕獲與解讀。因此，本書將蛋白質組學（Proteomics）與代謝組學（Metabolomics）——這兩個直接反映細胞狀態和生理功能的核心組學領域——置於中心位置，探討如何通過它們的協同分析，構建更具魯棒性和生物學意義的標誌物組閤。 第一部分：理論基石與技術前沿 本書的開篇部分，聚焦於蛋白質組學和代謝組學的基礎理論框架與核心技術平颱。 在蛋白質組學部分，我們詳盡闡述瞭從樣本製備、酶切（如胰酶、胰凝蛋白酶、賴氨酸-C）到質譜分析的整個流程。重點剖析瞭當前主流的定性和定量策略，包括標記定量技術（如TMT、iTRAQ）和非標記定量技術（如SILAC、數據依賴采集DDA與數據非依賴采集DIA）。本書特彆強調瞭深度蛋白質組學在揭示蛋白質翻譯後修飾（PTMs，如磷酸化、泛素化、糖基化）中的關鍵作用，因為PTMs往往是調控信號通路活性和細胞功能的最直接開關。我們深入探討瞭新型高分辨質譜儀（如Orbitrap係列）在提高分析靈敏度和準確性方麵的突破，並輔以實際案例說明如何應對復雜生物樣本（如血漿、腫瘤組織）中的低豐度蛋白挑戰。 在代謝組學方麵，本書側重於闡述小分子代謝物在反映疾病狀態“當下”功能水平上的無可替代性。我們詳細介紹瞭基於核磁共振波譜（NMR）和質譜（MS）的分析方法，並對平颱型代謝組學與靶嚮型代謝組學進行瞭深入的對比分析。尤其關注瞭代謝物在不同器官係統（如能量代謝、脂質代謝、神經遞質代謝）中的網絡構建，以及如何利用這些網絡來捕捉代謝重編程這一癌癥等重大疾病的關鍵特徵。 第二部分：通路整閤與生物標誌物發現策略 本書的精髓在於“途徑分析”與“整閤模型”的構建。單純的差異錶達分析容易産生大量噪音和功能不明確的分子列錶。本書引導讀者超越分子列錶，深入到生物學通路層麵。 我們詳細闡述瞭如何利用生物信息學工具，將蛋白質組和代謝組的數據集映射到KEGG、Reactome等標準化的代謝通路數據庫中。通過通路富集分析，我們可以識彆齣在疾病狀態下被共同激活或抑製的分子集群，極大地提高瞭標誌物的生物學解釋力和臨床應用潛力。 在多組學整閤策略方麵，本書提供瞭從水平整閤（如簡單加權平均）到高級統計模型（如偏最小二乘判彆分析PLS-DA、多視圖學習方法）的過渡指南。核心在於闡明蛋白質與代謝物之間的因果或協同關係：例如，某個激酶的磷酸化水平（蛋白質組信息）如何直接影響下遊酶的活性，進而改變特定代謝物的濃度（代謝組學信息）。這種整閤視角，使得發現的標誌物不再是孤立的分子，而是具有特定生物學意義的“通路簽名”。 第三部分：生物標誌物的驗證與臨床轉化 發現隻是第一步，穩健的驗證和最終的臨床轉化是衡量生物標誌物價值的最終標準。本書在這一部分傾注瞭大量篇幅，確保研究結果能夠經受住嚴格的科學和臨床檢驗。 樣本特異性與隊列構建： 我們強調瞭生物樣本來源（血液、尿液、組織、體液）對標誌物選擇和解釋的巨大影響。書中提供瞭構建具有代錶性、無偏見、多中心驗證隊列的詳細設計原則，包括如何處理批次效應和樣本異質性。 生物標誌物的性能評估： 詳細解析瞭關鍵的統計學指標，如靈敏度（Sensitivity）、特異性（Specificity）、準確率（Accuracy），以及受試者工作特徵麯綫（ROC麯綫）的構建與解讀。特彆關注瞭如何通過交叉驗證（Cross-validation）和外部數據集驗證來評估模型的泛化能力。 技術平颱間的交叉驗證： 鑒於不同質譜平颱和分析條件的差異，本書討論瞭如何利用正交的分析方法（如使用LC-MS/MS發現的標誌物，使用NMR進行獨立驗證）來增強生物標誌物的可靠性。 臨床應用的前景： 最後，本書展望瞭蛋白質組學和代謝組學標誌物在疾病風險分層、早期篩查、藥物反應預測（伴隨診斷）等方麵的未來應用潛力，並討論瞭從實驗室數據到臨床決策支持係統的技術壁壘和監管路徑。 結語 《蛋白質組學和代謝組學途徑的生物標誌物發現》是一本麵嚮未來、高度實用的參考書。它不僅細緻描繪瞭如何操作復雜的組學技術，更重要的是，它提供瞭一種整閤的、以生物學通路為導嚮的思維模式。通過係統性地整閤蛋白質的功能信息和代謝物的生理狀態信息，本書旨在幫助研究人員突破單一數據維度的限製，發現真正能夠反映生命係統復雜性和動態性的新型、高價值的疾病生物標誌物，從而加速精準醫學的進程。這本書是連接基礎科學與臨床實踐之間一座至關重要的橋梁。

評分☆☆☆☆☆

天呐，這本書簡直是為我這種對生命科學前沿充滿好奇的業餘愛好者量身定做的！我最近剛好在嘗試理解一些復雜的生物學概念，市麵上那些教材要麼過於晦澀難懂，要麼就是蜻蜓點水般一筆帶過。但這本書給我的感覺完全不同，它仿佛是一位經驗豐富的導師，耐心地把我領進一個充滿未知和希望的領域。我特彆欣賞作者在構建知識體係上的匠心獨運，他們沒有一上來就拋齣那些令人望而生畏的專業術語，而是從最基礎的分子層麵講起，循序漸進地搭建起一個完整的認知框架。舉個例子，關於如何從海量數據中“篩選”齣真正有意義的信號，書中用瞭好幾個生動的比喻，將復雜的統計學和生物信息學原理變得直觀易懂。我甚至能想象齣在實驗室裏，研究人員麵對著堆積如山的質譜數據時，是如何運用書中所述的方法，撥開迷霧，最終鎖定那幾個關鍵的“指紋”。閱讀過程中，我時常需要停下來，反復琢磨那些圖示和流程圖，它們清晰地展示瞭從樣本采集到數據分析的每一個關鍵步驟，讓人不禁感嘆科學研究的嚴謹與精妙。這本書的深度足以滿足專業人士的需求，但其錶達的溫度和清晰度，又讓像我這樣的跨界學習者也能從中汲取營養，真正體會到探索生命奧秘的樂趣。它不僅僅是一本書，更像是一張通往精準醫學未來世界的路綫圖，讓人對未來的生物技術發展充滿期待。

評分☆☆☆☆☆

我得說，這本書的齣版，無疑是對當前生物學研究領域一個極具價值的補充。我關注這個領域已經有些年頭瞭，深知“大數據”時代下，如何有效整閤蛋白質組學和代謝組學這些高通量技術産生的信息流，一直是科研工作者麵臨的巨大挑戰。這本書的獨特之處在於，它真正做到瞭“係統整閤”。很多同類書籍往往側重於單一技術平颱的介紹，比如隻講質譜儀器的優化，或者隻談代謝物注釋的算法，讀完後總覺得知識是碎片化的。然而，這本書仿佛搭建瞭一個宏大的指揮中心，把不同層麵的技術和理論有機地聯係瞭起來。我尤其欣賞它對“數據質量控製”的重視程度，這一點在很多浮躁的文獻和教材中常常被輕描淡寫。書中詳細闡述瞭如何識彆和校正批次效應、如何處理缺失值，這些看似枯燥但至關重要的環節，恰恰決定瞭後續生物學解釋的可靠性。當我閤上書本，腦海中浮現的不再是一個個孤立的技術名詞，而是一個完整的、可重復、可驗證的實驗與分析流程。對於正在進行博士課題或者需要設計復雜生物標誌物驗證實驗的研究者來說，這本書提供的操作層麵的指導和哲學層麵的思考，是無可替代的財富。它教會我們如何提齣更閤理的問題，以及如何用更嚴謹的方法去尋找答案。

評分☆☆☆☆☆

這本書帶來的最深刻的感受，是一種跨學科思維的碰撞和啓發。我原先的背景更多偏嚮於傳統的分子生物學，對於大規模數據分析和計算生物學方法論的理解相對薄弱。閱讀這本書的過程中，我仿佛被拉入瞭一個全新的“語言環境”。它並沒有強迫我成為一名專業的生物信息學傢，而是用一種“翻譯官”的口吻，將復雜的計算模型和統計假設，轉化成瞭生物學傢能夠理解的邏輯框架。比如，書中對“多重檢驗校正”的闡述，不僅解釋瞭P值的重要性，更結閤生物學背景，說明瞭為何在一個擁有數韆個目標分子的數據集中，必須采取更為保守的策略。這種跨越學科壁壘的對話能力，是當前科研工作最稀缺的資源之一。它鼓勵讀者——無論你的主業是生物學、醫學還是工程學——都能以一種更開闊的視角去看待問題。讀完之後，我開始重新審視自己手頭的一些老數據，思考是否能應用書中提及的新方法進行再分析，或者在設計未來的實驗時，如何更早地將計算的需求納入實驗方案的考量。這本書真正實現瞭“打開思路”的功能，讓我意識到，未來的生物標誌物發現，必然是多學科深度融閤的産物，而這本書，正是這場融閤的絕佳催化劑。

評分☆☆☆☆☆

這本書的裝幀設計和排版風格，給我的閱讀體驗增添瞭意想不到的愉悅感。在這個充斥著電子文檔和快速閱讀的時代，捧起一本紙質書，感受油墨的觸感，本身就是一種享受。而這本《科學與自然》係列的書籍，繼承瞭該係列一貫的高水準：紙張厚實，不易反光，即便是長時間麵對那些復雜的化學結構圖和熱力學圖錶，眼睛也不會感到明顯的疲勞。更值得稱贊的是其邏輯結構的可視化處理。那些流程圖和概念圖的設計，絕非敷衍瞭事。它們運用瞭非常現代且清晰的色彩編碼和布局，使得原本可能讓人眼花繚亂的信息層級得到瞭極佳的梳理。比如，當它解釋一個復雜的反饋調節網絡時，圖示中的箭頭粗細、顔色深淺，都巧妙地暗示瞭信號強弱和關鍵性，這比純文字描述效率高齣百倍。我常常會把書翻到特定的章節，不是為瞭重讀文字，而是單純地欣賞那些精心製作的圖錶。這說明編者在內容生産的同時，也深刻理解瞭“閱讀體驗”的重要性——科學的復雜性不應該以犧牲清晰度為代價。這份對細節的尊重，讓這本書從眾多專業書籍中脫穎而齣，成為我書架上願意反復翻閱的“工具書”和“賞心悅目之作”。

評分☆☆☆☆☆

從一個長期在臨床轉化領域摸爬滾打的人的角度來看，這本書為“從實驗室到臨床”架起瞭一座堅實的橋梁。我們都知道，蛋白質組學和代謝組學研究的最終目標，是發現能夠用於疾病診斷、預後判斷或療效監測的生物標誌物。然而，許多研究常常止步於初步的“發現”階段，缺乏將這些潛在標誌物轉化為可靠工具的深入探討。這本書的後半部分，恰恰是對此問題的有力迴應。它沒有迴避生物標誌物驗證過程中的“陷阱”，比如樣本異質性、技術平颱間的差異，以及最重要的——統計學上的“假陽性”問題。作者們以非常務實和批判性的眼光，審視瞭當前各種驗證策略的優劣，甚至提及瞭臨床試驗設計中應考慮的樣本量估算和盲法執行等實際操作問題。這讓我感到非常受用，因為它不再是純粹的“理論介紹”，而是“實戰手冊”。它提醒我們，一個好的生物標誌物，需要的不僅僅是高倍差異，更需要的是在不同人群、不同條件下都能保持穩定性和可重復性的“魯棒性”。這種對研究嚴謹性的深度挖掘，極大地提升瞭本書的學術價值，也為我們這些希望將科研成果真正落地的人，提供瞭寶貴的實踐指導。