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蔡祿 著

圖書標籤:

• 生物信息學
• 計算生物學
• 基因組學
• 蛋白質組學
• 序列分析
• 數據庫
• 算法
• Python
• R語言
• 生物統計學

齣版社： 化學工業齣版社

ISBN：9787502596064

版次：1

商品編碼：10280614

包裝：平裝

開本：小16開

齣版時間：2008-05-01

頁數：305

內容簡介

伴隨著人類及其他生物基因組計劃的實施，生物信息學迅速成為生命科學的前沿領域。生物信息學是生物學與物理學、化學、數學、信息科學及計算機科學交叉的學科。各種生物信息數據呈指數式增長趨勢，運用計算機管理數據、控製誤差、加速分析過程勢在必行。在此基礎上解釋實驗現象，認識導緻實驗現象發生的本質，在“整閤”、“係統”等全新理念下探索生物學規律，進而瞭解和掌握生命的物質基礎和生命的本質成為當今生物學發展的趨勢。
本書從生物信息學研究對象及主要研究內容、生物信息學資源、序列分析、序列比對、係統發生分析、基因組生物信息學、生物芯片、後基因組生物信息學幾個方麵進行瞭詳細的介紹。
本書內容新穎、簡明扼要、內容深淺適度。可作為生物信息學、分子生物學、遺傳學、細胞生物學、醫學及其他相關專業高年級本科生、研究生的教材，也可供教師和研究人員學習、參閱使用。

目錄

第1章 生物信息學引論
第2章 生物學基礎
第3章 生物信息學資源與數據挖掘工具
第4章 序列分析
第5章 序列比對
第6章 分子係統發生分析
第7章 基因組信息學分析
第8章 生物芯片
第9章 後基因組時代的生物信息學
參考文獻

曆史的洪流與文明的軌跡：一部人類社會變遷的宏大敘事 圖書名稱：曆史的洪流與文明的軌跡 圖書簡介 本書並非探討生命科學領域的前沿技術，亦無涉分子結構、基因測序或生物信息處理的復雜算法。它是一部雄心勃勃、力求深刻的通史著作，旨在梳理和剖析自史前時代至近現代全球範圍內人類社會、政治、經濟與文化形態的演變脈絡。我們試圖超越簡單的時間順序羅列，深入挖掘驅動曆史車輪滾滾嚮前的核心動力——技術革新、思想衝突、地理環境的製約與人類共同體的互動模式。 第一部分：蠻荒與萌芽——早期人類社會的形成與文化起源（約占全書篇幅的15%） 本部分聚焦於人類物種的起源及其早期適應性行為。我們從非洲大裂榖的早期猿人足跡開始，描摹智人如何通過工具製造、火的使用和語言的初步發展，逐步走齣非洲，徵服瞭地球上大部分適宜生存的區域。重點探討舊石器時代晚期的“文化大爆炸”——藝術、符號思維和復雜社會結構的齣現。隨後，我們將筆觸轉嚮新石器革命，詳述農業的起源如何徹底改變瞭人類的生活方式。定居、人口增長、剩餘産品的産生，以及隨之而來的社會階層化，是這一階段的關鍵詞。我們細緻分析瞭美索不達米亞、尼羅河榖、印度河流域和黃河中下遊地區早期文明的獨立發生路徑，對比瞭灌溉技術、神權政治與文字係統的早期形態。 第二部分：古典文明的輝煌與重塑——帝國、哲學與軸心時代（約占全書篇幅的25%） 這一部分深入剖析瞭公元前1000年至公元500年間，奠定後世西方乃至全球思想基礎的古典文明。首先，對古希臘城邦民主製的獨特實踐及其在哲學、數學和戲劇領域的突破進行瞭詳細闡述，特彆關注蘇格拉底、柏拉圖和亞裏士多德的思想遺産對後世政治哲學的深遠影響。緊接著，我們轉嚮東方，分析瞭波斯帝國的中央集權模式、印度的種姓製度及其吠陀傳統的演變。中華文明的周秦變革，特彆是儒傢思想對社會倫理和國傢治理的奠定，構成瞭理解東亞曆史的關鍵。 本部分的高潮在於“軸心時代”的跨文明比較研究——在幾乎同步的時期內，為何從希臘到印度，從中國到近東，齣現瞭關注人類終極價值和道德規範的強大思想體係。這種現象並非偶然，而是社會復雜化達到一定臨界點後的必然産物。最後，探討羅馬帝國的興衰，不僅是軍事和法律的勝利，更是其內部結構矛盾、財政壓力以及基督教作為一種顛覆性宗教如何最終改變瞭西方世界版圖的過程。 第三部分：中世紀的過渡與重構——連接與斷裂的韆年（約占全書篇幅的20%） 古典帝國崩潰後，世界並未陷入全然的黑暗，而是進入瞭復雜而多元的重構期。在西歐，封建製度在權力分散的背景下萌芽，教會成為整閤社會秩序的核心力量。十字軍東徵不僅是宗教衝突，更是東西方經濟和知識交流的催化劑。 與此同時，伊斯蘭文明的崛起及其黃金時代是本章的另一重點。從西班牙的科爾多瓦到巴格達的智慧宮，伊斯蘭學者在繼承和發展古希臘、波斯、印度知識體係方麵的貢獻被細緻描繪。我們探討瞭其在代數、醫學和天文學上的創新如何為後來的歐洲文藝復興積蓄瞭能量。在東亞，唐宋時期的中國，其技術（如印刷術、火藥）和經濟（如宋代的商業革命）的領先地位，構成瞭與西方截然不同的發展路徑。 第四部分：全球的匯閤與衝擊——大航海時代與早期現代性（約占全書篇幅的25%） 本書將重點分析15世紀末開始的“地理大發現”如何徹底打破瞭原有的文明孤島格局。我們考察瞭歐洲航海技術的進步、資本主義萌芽的內在驅動力，以及由此引發的大西洋三角貿易體係的建立。哥倫布交換（Columbian Exchange）對全球生態、人口結構和經濟權力的重塑是本章的核心分析對象。 在思想領域，文藝復興對人文主義的重新發掘，宗教改革對既有權威的挑戰，以及科學革命（哥白尼、伽利略、牛頓）如何確立瞭一種以實證和理性為基礎的新的世界觀，是構建早期現代性的關鍵要素。政治上，專製王權的加強與早期民族國傢的形成之間的張力，為隨後的革命埋下瞭伏筆。 第五部分：革命、工業化與現代世界的塑造（約占全書篇幅的20%） 最後一部分關注18世紀中葉至今的劇變。首先是對啓濛運動思想如何轉化為政治實踐——美國獨立戰爭和法國大革命——的深入分析，考察瞭自由、平等、民族主義這些現代核心概念的誕生及其曆史局限性。 隨後，工業革命的爆發及其對社會結構、階級關係和城市化的顛覆性影響被詳細闡述。蒸汽機、工廠製度和全球化資本的擴張如何以前所未有的速度改變瞭人類的物質生活和環境。本章也將批判性地審視19世紀的帝國主義擴張、兩次世界大戰對全球秩序的破壞，以及冷戰格局的形成與解體。 全書最終聚焦於後冷戰時代的全球化挑戰，包括技術進步帶來的社會重組、氣候變化對人類生存環境的長期影響，以及文化身份認同在日益緊密的世界中的復雜變遷，以期為讀者提供一個理解我們當下所處曆史位置的廣闊視角。本書旨在展現人類文明的韌性、創造力，以及在曆史洪流中不斷自我修正的艱辛曆程。

評分☆☆☆☆☆

坦白說，《生物信息學教程》這本書的閱讀體驗，對我來說是一次不小的“磨煉”。它顯然不是那種輕鬆愉快的讀物，而是需要靜下心來，認真思考，甚至需要反復推敲的。書中涉及大量的算法和統計概念，對於我這樣非計算機專業背景的讀者來說，理解起來確實有一定難度。我常常在閱讀某個算法的描述時，會發現自己之前對某個數學公式或者統計檢驗的理解並不牢固，又得迴頭去查閱相關的背景知識。不過，正是這種“卡殼”和“迴頭”的過程，讓我對知識的理解更加紮實。書中給齣的例題和練習題，雖然有些難度，但都非常有針對性，能夠幫助我檢驗學習效果，加深對概念的理解。我記得有一次，我花瞭一個下午的時間去解決一個關於序列比對參數選擇的練習題，從一開始的不知所措，到最後通過反復嘗試和對比，終於找到瞭最優解，那種成就感是巨大的。這本書讓我明白，學習生物信息學，不僅僅是學習工具的使用，更是培養一種嚴謹的科學思維和解決問題的能力，而這些，恰恰是它所帶來的寶貴財富。

評分☆☆☆☆☆

讀完這本《生物信息學教程》，我最大的體會是它提供瞭一個非常係統且全麵的知識框架。我之前零散地學過一些生物信息學相關的知識，但總覺得缺乏連貫性，像是東拼西湊。而這本書，從最基礎的生物序列數據的錶示和存儲，到各種序列分析算法（如BLAST、FASTA），再到基因組學、蛋白質組學、轉錄組學等各個分支的介紹，都做得非常到位。每一章的內容都像是為下一章打下瞭堅實的基礎，循序漸進，讓我能夠逐步構建起對整個領域的認知。特彆值得一提的是，書中對數據可視化和統計分析的強調，讓我認識到，冰冷的數字和圖錶背後，往往隱藏著重要的生物學信息，而如何有效地呈現和解讀這些信息，是生物信息學工作者必備的技能。我尤其喜歡書中關於“如何設計一個生物信息學分析流程”的章節，它不僅僅是教你使用工具，更是教你如何思考，如何根據生物學問題選擇閤適的分析方法和工具，如何進行結果的驗證和解釋。這種“授人以漁”的教學方式，讓我感覺受益匪淺，也讓我對未來進行獨立分析充滿瞭信心。

評分☆☆☆☆☆

這本《生物信息學教程》我前前後後也花瞭不少時間來啃。最初吸引我的，是它那個樸實無華的書名，感覺像是那種能把復雜的知識梳理得條條是道，讓我們這些初學者也能看得懂的“教科書”。剛翻開的時候，確實就被撲麵而來的各種專業術語和圖錶給“鎮”瞭一下，但不得不說，作者在概念的引入上做瞭不少努力。他用瞭很多生動的比喻，把那些抽象的算法、數據庫操作，甚至是什麼序列比對的原理，都變得形象起來。我記得有一章講的是基因組組裝，那個過程，作者用瞭“拼圖”來類比，把每個片段比作拼圖的碎片，最後要找最優的組閤方式拼接起來，雖然原理肯定遠不止這麼簡單，但至少讓我對整個流程有瞭一個大緻的輪廓。而且，書中對各種常用軟件工具的介紹也相當詳盡，從安裝配置到基本使用，都給齣瞭詳細的步驟和截圖，這一點對於動手實踐能力相對較弱的我來說，簡直是救星。我常常是邊看書邊跟著操作，遇到問題也基本能在書裏找到解決方案，這種“手把手”的教學模式，讓我少走瞭不少彎路，也確實讓我從對生物信息學的一竅不通，變成瞭一個能初步運用這些工具解決一些實際問題的“半吊子”。

評分☆☆☆☆☆

這本《生物信息學教程》給我最大的感觸是它的“實用性”和“前沿性”。它不僅僅停留在理論層麵，而是緊密結閤瞭當前生物信息學研究的最新進展和實際應用。書中對一些新興技術和方法，比如單細胞測序數據分析、宏基因組學研究等，都有比較詳細的介紹，讓我能夠瞭解到這個學科的最新動態。而且，書中提供的許多案例分析，都是基於真實的生物學研究數據，這讓學習過程變得更加生動有趣，也更容易讓我理解這些分析方法在實際研究中的價值。我特彆喜歡其中關於“數據挖掘與知識發現”的章節，它不僅僅教我如何從海量數據中提取信息，更啓發瞭我如何將這些信息轉化為有價值的生物學知識，甚至發現新的科學規律。這本書的編寫風格也非常清晰，段落分明，邏輯性強，即使內容很多，也不會讓人覺得雜亂無章。我常常在學習過程中，會不自覺地將書中的內容與我正在閱讀的生物學文獻聯係起來，發現很多方法和概念都是共通的，這大大提升瞭我的閱讀效率和理解深度，也讓我覺得，掌握瞭這本書的內容，就等於掌握瞭一把開啓現代生物學研究大門的鑰匙。

評分☆☆☆☆☆

拿到這本《生物信息學教程》後，我最大的感受就是它的“硬核”程度。我之前對生物信息學接觸不多，更多的是從一些科普文章或者新聞報道中零星瞭解，總覺得它神秘又遙遠。這本書的內容，真的是把我拉到瞭一個更深層次的領域。它並沒有迴避那些復雜的數學模型和統計學原理，而是很直接地就展開瞭。例如，在講到機器學習在生物信息學中的應用時，書中深入探討瞭支持嚮量機、決策樹等算法的數學推導過程，這對我來說是個不小的挑戰。我不得不反復閱讀，甚至去查閱一些相關的數學資料，纔能勉強理解其中的邏輯。不過，也正是這種深入的講解，讓我對生物信息學背後的科學原理有瞭更深刻的認識。它不僅僅是工具的使用，更是對數據背後規律的挖掘和模型的建立。書中的案例分析也很有代錶性，它展示瞭如何利用生物信息學的方法來解決一些具體的生物學問題，比如預測蛋白質結構、識彆疾病相關的基因突變等等。雖然有些案例的實現細節我暫時還無法完全掌握，但它讓我看到瞭生物信息學強大的生命力，也激發瞭我進一步探索的興趣，讓我覺得這個領域真的大有可為。