生命科学实验指南系列:生命科学实验设计指南 [Experimental Design for Biologists]

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[美] D.J.格拉斯 著,丛羽生 等 译
图书标签:
  • 生命科学
  • 实验设计
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  • 数据分析
  • 实验方案
  • 科学研究
  • 方法论
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出版社: 科学出版社
ISBN:9787030213419
版次:1
商品编码:12167952
包装:平装
丛书名: 生命科学实验指南系列
外文名称:Experimental Design for Biologists
开本:16开
出版时间:2008-05-01
用纸:胶版纸
页数:169
字数:213000
正文语种:中

具体描述

内容简介

  随着人类和其他物种基因组的破译,生物信息科学的发展,生命科学已成为21世纪*为活跃、发展*为迅速的先导性学科之一。国内各高校十分重视生命科学的发展,相继设立了本科生创新科研项目以及研究策略和实验设计方面的课程。研究生培养也以科学研究水平为标准。《生命科学实验指南系列:生命科学实验设计指南》作者基于多年教学科研经验以及与著名专家学者交流的基础,对生物学研究策略和实验设计进行深入细致的解析。
  《生命科学实验指南系列:生命科学实验设计指南》可作为生命科学专业高年级本科生和研究生的教材和参考资料。

内页插图

目录

前言
1 确定实验项目
2 假说是科学研究课题的框架
3 科学地处理不切实际的假说
4 把问题作为科学研究的基准框架
5 是什么构成了实验问题的合理解释?
6 如何用实验结论来描绘现实
7 为实验建立模型
8 设计实验
9 将模型合理化
10 设计实验方案
11 实验重复
12 阴性对照的重要性
13 阳性对照的重要性
14 方法和试剂
15 研究对象对照
16 假定对照
17 实验者对照
18 有关生物教条主义的描述
19 简短概述
索引

前言/序言

  这本书是我在生物制药公司Regeneron Pharmaceuticals开设一门关于实验设计的短期课程时的产物。我要对在课程中给予我回应的所有人表示感谢。像很多想法一样,将这门课写成一本书的想法最初来自于一番酒后之言——当时我正在和科学家同事DanFinley,Fred Goldberg和Allan Weissman讨论实验设计并没有在研究生院里被广泛教授给未来的科学家这一事实,并且批判理性主义和科学实践之间有着巨大的差距。
  当然,如果没有出版商想出版的话,这本书还是不能够问世。因此,我非常感激冷泉港实验室出版社的David Crotty。在Ginger Peschke和Maria Smit的帮助下,非常能干的SianCurtis将手稿编辑出来。Jan Argentine和她出版社的同事审查了稿件。特别感谢Sian和Jan自始至终的反馈和热情。也同样非常感谢Rene Steuer专业的产品介绍,Susan Schaefer的排版,以及Denise Weiss专业的设计。
  在编写本书的过程中,Kumar Dharmarajan给了我很大的帮助。Kumar是我实验室曾经的学生和实习生,并在本书完成大半的时候成为了哥伦比亚大学的一名医科学生。因此他扮演了“未来的读者”的角色,并为每一章都提出了宝贵的意见,找出表述不明的地方,并帮助改写。非常感谢他为此做出的贡献和献出的宝贵时间。我实验室的Brian Clarke也阅读了大量手稿,筛选出了许多需要明确的章节。
  Woody Fu——我以前的学生——现在承担了许多工作,包括卡通制作。他为本书绘制的三幅漫画如此之好,以至于我们为无法进一步发挥他的才能而感到遗憾。
  还要感谢诺华公司的全体成员对我这一工作的支持。诺华公司对于继续教育非常重视。发现本书激起了公司的热情是一件非常快乐的事情。特别的感谢还要献给统计学家Leah Martell和Mathis Thoma,他们仔细审查了书中的数据以避免统计学上的误述。如果书中仍存在问题,那都是我一个人的错。听到读者的反馈我将非常高兴,你们提出的意见和问题将在再版时进行改正。我的电子邮箱是:expdesignbiology@gmail.com,请随时与我联系。
好的,这是一份关于另一本图书的详细简介,该书与您提到的《生命科学实验指南系列:生命科学实验设计指南 [Experimental Design for Biologists]》内容无关。 --- 图书名称: 基因编辑与精准医疗前沿:CRISPR技术的深入解析与应用拓展 作者: [此处应填写作者姓名或团队] 出版社: [此处应填写出版社名称] 出版年份: [此处应填写年份] --- 图书简介:基因编辑与精准医疗前沿:CRISPR技术的深入解析与应用拓展 引言:打开生命科学的潘多拉魔盒 自2012年CRISPR-Cas9系统被确立为一种高效、精确的基因编辑工具以来,生命科学领域的研究范式经历了根本性的变革。这项源自细菌免疫系统的技术,以其前所未有的灵活性和易用性,迅速成为生物医学研究、农业生物技术以及疾病治疗领域的核心驱动力。然而,随着CRISPR技术的快速发展,新的挑战与机遇并存。要充分利用这一革命性工具的潜力,研究人员不仅需要掌握其基础原理,更需要深入理解其在复杂生物系统中的实际应用、潜在的脱靶效应控制,以及伦理与监管框架。 本书《基因编辑与精准医疗前沿:CRISPR技术的深入解析与应用拓展》正是为了满足这一迫切需求而编写的。它旨在为生物学家、临床研究人员、生物工程师以及对基因编辑技术感兴趣的专业人士,提供一个全面、深入且与时俱进的技术指南与前沿综述。本书不仅详细剖析了CRISPR系统的演进历程和分子机制,更聚焦于其实际应用中的工程学挑战和生物学复杂性。 第一部分:CRISPR系统的演进与基础机制 本书的第一部分奠定了坚实的理论基础。我们从CRISPR-Cas系统的起源讲起,追溯其在细菌和古细菌中的天然防御机制。随后,重点解析了CRISPR-Cas9系统的核心组件——Cas9蛋白与sgRNA(单向导RNA)的协同作用,如何实现对目标DNA序列的精确识别和切割。 在此基础上,本书系统地介绍了CRISPR家族中涌现出的“第二代”和“第三代”编辑工具。这包括利用核酸酶失活的dCas9介导的基因调控技术(如CRISPRi和CRISPRa),以及更具革命性的碱基编辑(Base Editing)和先导编辑(Prime Editing)技术。我们对这些新工具的分子机制进行了详尽的阐述,对比了它们在编辑精度、脱靶风险和适用范围上的优劣,帮助读者理解如何根据实验目标选择最合适的工具。 第二部分:脱靶效应的评估与控制策略 任何基因编辑技术都必须面对“脱靶效应”这一核心挑战。本书用相当篇幅专门探讨了如何识别、量化和最小化非预期基因组编辑。我们详细梳理了当前主流的脱靶预测算法和高通量检测方法,如CIRCLE-seq、GUIDE-seq和Digenome-seq等。 更重要的是,本书深入讨论了工程学层面的解决方案。这包括对Cas蛋白进行结构改造以提高特异性(如高保真Cas9变体),优化sgRNA的设计策略,以及利用化学修饰或低温等方式来调节核酸酶的活性窗口,从而在保证编辑效率的同时,显著降低脱靶事件的发生率。 第三部分:CRISPR技术在生物医学中的深度应用 本书的第三部分是关于CRISPR技术在转化医学中的实际应用案例集锦。我们没有停留在基础研究层面,而是聚焦于如何将这些工具转化为可行的治疗手段。 体外编辑与细胞治疗: 详细讨论了CAR-T细胞疗法、iPSC(诱导多能干细胞)重编程以及利用CRISPR技术修复致病性突变细胞株的应用案例,包括如何设计高效的细胞转导/转染方案。 体内递送系统的优化: 成功的基因治疗依赖于高效、安全的递送。本书系统比较了病毒载体(如AAV)和非病毒载体(如脂质纳米颗粒LNP)在将CRISPR元件递送到特定组织和器官中的优势与局限性。特别关注了靶向肝脏、神经系统和肿瘤组织的递送策略的最新突破。 疾病模型构建与药物筛选: 阐述了如何利用CRISPR/Cas12/Cas13等系统快速、高通量地构建人类疾病的精准动物模型和类器官模型,并将其应用于新药靶点的验证和先导化合物的筛选流程中。 第四部分:超越DNA:RNA编辑与表观遗传调控 随着研究的深入,CRISPR的应用范围已不再局限于基因组DNA的永久性修改。本书的第四部分拓展了读者的视野,介绍了CRISPR在可逆性调控方面的最新进展。 CRISPR/Cas13介导的RNA编辑: 详细解析了Cas13家族在靶向和切割RNA方面的作用,以及如何利用其进行RNA水平的基因沉默、异源性RNA检测(如SHERLOCK系统),为病毒感染和快速诊断提供了新的视角。 表观遗传重编程: 探讨了利用失活的Cas9(dCas9)与表观遗传修饰酶(如DNA甲基转移酶、组蛋白乙酰转移酶)的融合蛋白,实现对基因表达的动态、可逆调控,这在发育生物学和慢性病管理中展现出巨大潜力。 总结与展望:伦理、监管与未来方向 在最后一部分,本书超越了纯粹的技术层面,探讨了基因编辑技术所引发的社会、伦理和法律议题。我们客观分析了对人类生殖细胞进行编辑的争议,以及各国在体细胞治疗和基础研究中的监管现状。 《基因编辑与精准医疗前沿:CRISPR技术的深入解析与应用拓展》力求成为一本兼具学术深度与实践指导性的参考书。它不仅指导读者如何操作这些工具,更引导读者思考如何设计更严谨的实验,如何评估结果的可靠性,以及如何在快速迭代的技术浪潮中把握研究的前沿方向。对于希望在基因编辑领域进行创新性研究的科研工作者而言,本书是不可或缺的指南。 ---

用户评价

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坦率地说,这本书的上手难度不低,它要求读者已经具备一定的生物学基础知识,否则初次接触其中的统计术语和实验设计术语时,可能会感到力不从心。我刚开始翻阅时,确实有过几次想要合上的冲动,觉得内容过于学术化和抽象。然而,一旦坚持度过最初的适应期,你会发现这种“硬核”恰恰是其价值所在。它没有采用那种为了迎合初学者而过度简化的叙述方式,而是直面了生命科学研究中真实存在的复杂性与不确定性。对于那些正准备着手进行毕业设计或申请研究基金的人来说,这本书提供的框架和案例分析具有极高的实操指导意义。它更像是一本高级研修班的教材,而不是入门读物,它不是在教你“怎么做”,而是在教你“怎么思考如何做才是最严谨的”。

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阅读这本书的过程,简直是一次对传统生物学思维定式的颠覆性洗礼。我原以为设计实验无非是确定变量、设置对照那么简单,但这本书深入剖析了“为什么”要这么做,以及在不同情境下,哪些看似微不足道的假设或偏见可能会悄无声息地破坏整个研究的有效性。作者似乎拥有一种近乎偏执的对“零假设”的尊重,详尽地讨论了样本量计算背后的统计哲学,而不是仅仅停留在公式的堆砌。特别是关于因果推断和混杂因素控制的章节,文字密度虽然高,但逻辑链条异常清晰,读完之后,我感觉自己看实验报告的视角都变得锐利了许多,不再满足于“结果显示有差异”的肤浅结论,而是开始深究这种差异背后的设计合理性。这不仅仅是技术指导,更像是一次深刻的元认知训练,教会你如何像一个真正的科学家那样去质疑和规划。

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从实用性的角度来衡量,这本书的结构设计非常注重流程化和可追溯性。它不是按主题罗列知识点,而是模拟了科学研究的生命周期——从初步的假设提出,到资源评估,再到数据分析和结果解释的各个阶段,都有对应的章节进行详细拆解和指导。我特别欣赏它在“伦理考量与预实验规划”部分所占的比重。在很多实验书中,伦理和资源限制往往被一笔带过,但这本书将其提升到了与实验统计同等重要的地位,强调了科学的社会责任。这使得读者在学习技术的同时,也能培养起对研究投入产出比、潜在风险以及道德规范的全面考量,形成一种负责任的科研习惯,而非仅仅追求出成果的急功近利。

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这本书最让我惊喜的地方在于其跨学科的广博视野。它并没有局限于某一特定的生物学分支,而是将分子生物学、生态学乃至生物信息学的实验设计原则进行了宏观的整合。例如,它在讨论重复性和可重复性时,会引用不同领域内经典的“失败案例”作为反面教材,这种多维度的比较分析,极大地拓宽了我对“好的实验设计”的理解边界。我过去常常在不同领域的知识之间画出清晰的界限,但这本书巧妙地搭建了桥梁,展示了无论研究对象是蛋白质还是种群,其背后的科学逻辑架构都是相通的。这种整合能力,使得这本书的适用范围远远超出了那些只关注特定实验技术的书籍,它培养的是一种通用的、可迁移的科学方法论思维。

评分

这本书的装帧设计简直是教科书级别的典范,封面材质触感扎实,厚重中透着一股严谨气息。拿到手里,首先映入眼帘的是清晰排版的标题和作者信息,让人感觉这不是一本普通的指导手册,而是一份经过深思熟虑的学术工具。内页的纸张选用也十分考究,既不会反光影响阅读,又足够挺括,便于在实验台边反复翻阅。尤其让我印象深刻的是,书中的图表和流程图的绘制水平极高,线条流畅,色彩运用得当,即使是复杂的实验设计概念,也能通过这些视觉辅助工具迅速被理解。它仿佛是一位经验丰富的老教授,不仅在内容上倾囊相授,更在呈现方式上精益求精,确保读者在阅读过程中享受到一种近乎仪式感的学习体验。这种对细节的极致追求,无疑为全书奠定了专业可靠的基调,让人愿意把它放在触手可及的地方,随时取用,而不是束之高阁。

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好邯钢可口可乐了了可怜可怜我我弄

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内容详细,丰富。

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