序 qiax言 1 豬重要經濟性狀候選基因研究進展 1.1 繁殖性狀候選基因研究進展 1.1.1 雌激素受體基因 1.1.2 卵泡刺激素基因 1.1.3 促黃體素基因 1.1.4 骨形態發生蛋白基因 1.1.5 促性腺激素釋放激素及其受體基因 1.1.6 促紅細胞生成素受體 1.1.7 骨橋蛋白基因 1.1.8 榖胱甘肽硫轉移酶M2亞型基因 1.1.9 TGF-β1基因 1.1.10 催乳素受體基因 1.1.11 視黃醇結閤蛋白4基因 1.1.12 視黃酸受體基因 1.1.13視黃素X受體基因 1.1.14 甲狀腺素運載蛋白基因 1.2 脂肪性狀候選基因研究進展 1.2.1 肝細胞核因子-4α基因 1.2.2 肝X受體基因 1.2.3 Krox20基因 1.2.4 脂蛋白脂肪酶基因 1.2.5 脂肪酸結閤蛋白基因 1.2.6 肥胖基因 1.2.7 激素敏感脂肪酶基因 1.3 肉質性狀候選基因研究進展 1.3.1 腺苷1磷酸脫氨酶基因 1.3.2 腺苷琥珀酸裂解酶基因 1.3.3 氨基咪唑氨甲酰核苷酸轉甲酰基酶/次黃嘌呤核苷酸環水解酶基因 1.3.4 榖氨酰胺磷酸核糖焦磷酸酰胺轉移酶基因 1.3.5 鈣蛋白酶基因 1.3.6 半胱氨酸蛋白酶抑製劑B基因 1.4 肌肉生長性狀候選基因研究進展 1.4.1 生肌調節因子傢族 1.4.2 肌細胞增強因子2傢族 1.4.3 肌肉生長抑製素基因 1.4.4 I型蘭尼定受體基因 1.5 抗逆性狀候選基因研究進展 1.5.1 抗黏液病du基因 1.5.2 天然抗性巨噬蛋白l基因 1.5.3 唾液酸閤成酶基因 1.5.4 Toll樣受體傢族 1.5.5 冷誘導R*A結閤蛋白基因 1.5.6 Y-box結閤蛋白-1基因 1.6 體長性狀候選基因研究進展 1.6.1 多形性腺瘤基因 1.6.2 生殖細胞核因子 1.6.3 配體依賴的核受體輔阻遏物 2 豬基因剋隆與序列分析 2.1 材料與方* 2.1.1 實驗動物組織樣 2.1.2 菌株和剋隆載體 2.1.3 主要儀器設備 2.1.4 主要藥品和酶 2.1.5 緩衝液及主要溶液的配製 2.1.6 D*A的*取與檢測 2.1.7 組織zoxgR*A的*取與檢測 2.1.8 引物設計與閤成 2.1.9 cD*A剋隆 2.1.10 基因組D*A剋隆 2.1.11 主要分子生物學軟件及統計分析軟件 2.2 結果與分析 2.2.1 H*F-4α基因剋隆與序列分析 2.2.2 LXRα基因剋隆與序列分析 2.2.3 RXRα基因剋隆與序列分析 2.2.4 MEF2A基因剋隆及序列分析 2.2.5 CstB基因剋隆與序列分析 2.2.6 RPS3基因剋隆與序列分析 2.2.7 OP*基因剋隆與序列分析 2.2.8 EPOR基因剋隆與序列分析 2.2.9 GxRt丁及其受體基因剋隆與序列分析 2.2.10 長白豬ADSL基因剋隆與序列分析 2.2.11 長白豬PurH基因剋隆與序列分析 2.2.12 民豬GPAT基因剋隆與序列分析 2.2.13 民豬MyoG基因剋隆與序列分析 2.2.14 SRPK1/3基因剋隆與序列分析 2.2.15 BMP-6基因剋隆與序列分析 2.2.16 IGFBP7基因剋隆與序列分析 2.2.17 CIRP基因剋隆與序列分析 2.2.18 PDZR*3基因剋隆與序列分析 2.2.19 COX1基因剋隆與序列分析 2.2.20 *A*S基因剋隆與序列分析 2.2.21 *LJMB基因剋隆與序列分析 2.2.22 IgG重鏈基因剋隆與序列分析 2.2.23 IRG6基因剋隆與序列分析 2.2.24 OAS1基因剋隆與序列分析 2.2.25 YB1基因剋隆與序列分析 2.3 討論 2.3.1 關於取樣、R*A*取和反轉錄反應 2.3.2 cD*A剋隆 2.3.3 基因組D*A部分片段剋隆 3 豬基因錶達規律研究 3.1 材料與方* 3.1.1 實驗動物組織樣 3.1.2 主要儀器設備 3.1.3 zoxgR*A的*取與檢測 3.1.4 引物設計與閤成 3.1.5 反轉錄反應 3.1.6 綫性增長試驗 3.1.7 PCR擴增 3.1.8 瓊脂糖凝膠電泳檢測 3.1.9 競爭性RT-PCR 3.1.10 Real-time PCR反應 3.1.11 數據分析 3.2 結果與分析 3.2.1 RBP4基因的時空轉錄情況 3.2.2 RAR基因的時空轉錄情況 3.2.3 RXR基因的時空轉錄情況 3.2.4 TTR基因的時空轉錄情況 3.2.5 H*F-4α基因的轉錄情況 3.2.6 LXRa基因的時空轉錄情況 3.2.7 OP*基因的時空轉錄情況 3.2.8 MEf2基因的轉錄分析 3.2.9 EGR2及其調控相關基因的轉錄情況檢測 3.2.10 MC3及基因的轉錄分析 3.2.11 CstB基因的時空轉錄分析 3.2.12 LPL基因的時空轉錄分析 3.2.13 SRPK1/3基因的時空轉錄分析 3.2.14 BMP-6基因的定量檢測 3.2.15 IGFBP7基因的定量檢測 3.3 討論 3.3.1 相對定量RT-PCR分析 3.3.2 競爭勝RT-PCR分析 3.3.3 Real-time PCR分析 4 豬基因單核苷酸多態性分析 4.1 實驗方* 4.1.1 實驗動物組織樣 4.1.2 藥品和酶 4.1.3 主要儀器設備 4.1.4 基因組D*A的*取與檢測 4.1.5 引物設計與閤成 4.1.6 PCR_SSCP檢測 4.1.7 基因多態性的統計方* 4.2 結果與分析 4.2.1 EGR2基因的單核苷酸多態性分析 4.2.2 H*F-4α基因的單核苷酸多態性分析 4.2.3 ADSL基因的單核苷酸多態性分析 4.2.4 PurH基因的單核苷酸多態性分析 4.2.5 GPAT基因的單核苷酸多態性分析 4.2.6 SRPK1/3基因的單核苷酸多態性分析 4.2.7 GSTM2基因的單核苷酸多態性分析 4.2.8 TGF-β1基因的單核苷酸多態性分析 4.2.9 BMP-6基因的單核苷酸多態性分析 4.2.10 GxRHR基因的單核苷酸多態性分析 4.2.11 TLR4基因的多態性分析 4.2.12 PLAG1基因多態性分析 4.2.13 *R6A1基因多態性分析 4.2.14 LCORL基因多態性分析 4.3 討論 4.3.1 基因組D*A*取 4.3.2 PCR-SSCP多態性分析 5 豬基因功能分析 5.1 實驗方* 5.1.1 緩衝液及主要試劑的配製 5.1.2 引物的設計與閤成 5.1.3 細胞培養 5.1.4 R*A乾擾 5.1.5 過量錶達 5.1.6 熒光素酶活性測定 5.1.7 數據統計分析 5.1.8 生物信息學分析 5.2 結果與分析 5.2.1 Krox20對脂肪細胞的影響 5.2.2 Smad3、GDF8和MyoD對豬骨骼肌衛星細胞的影響及互作 5.2.3 民豬MyoG基因啓動子核心區定位 5.2.4 民豬CYP1A1基因啓動子核心區定位 5.2.5 民豬MC4R基因啓動子核心區定位 5.2.6 民豬FST基因啓動子核心區定位 5.3 討論 5.3.1 shR*A的設計與篩選 5.3.2 qiax體脂肪細胞體外培養 5.3.3 骨骼肌衛星細胞培養及鑒定 5.3.4 轉染效率的影響因素 5.3.5 Krox20對豬qiax體脂肪細胞增殖和分化的影響_ 5.3.6 Smad3、MyoD與GDF-8對豬骨骼肌衛星細胞增殖的影響 5.3.7 Smad3、MyoD與GDF-8在骨骼肌衛星細胞增殖過程中的調控網絡關係 5.3.8 MyoG基因啓動子區域生物信息學分析 5.3.9 MyoG基因啓動子活性分析 5.3.10 CYP1A1基因啓動子活性分析 5.3.11 MC4R基因啓動子活性分析 6 豬基因組織特異性錶達分析 6.1 材料與方* 6.1.1 載體與菌株 6.1.2 MC4R特異錶達載體的構建與錶達 6.1.3 FST基因特異錶達載體的構建與錶達 6.2 結果與分析 6.2.1 MC4R基因特異錶達載體的構建與錶達 6.2.2 FST基因特異錶達載體的構建與錶達 6.3 討論 6.3.1 MC4R-P1/P2重組質粒的構建 6.3.2 FST-P1、FST-P2重組質粒的構建 6.3.3 FST-P3、FST-P4重組質粒的構建 6.3.4 Tet-Ox係統的優點 6.3.5 瞬時轉染後細胞狀態的觀察 6.3.6 誘導錶達基因的檢測 6.3.7 誘導MC4R基因對CMS係統的影響 6.3.8 FST與MyoD、MyoG、MST*、GDF11之間的互作分析 7 高通量測序分析豬差異錶達基因 7.1 材料與方* 7.1.1 實驗材料與測序 7.1.2 數據整理與分析 7.2 結果與分析 7.2.1 測序質量評估 7.2.2 cleax tag拷貝數分布統計 7.2.3 clearx tag比對統計 7.2.4 差異錶達基因及部分功能基因的錶達 7.2.5 反義轉錄本與新轉錄本預測結果 7.2.6 GO功能顯著性富集分析 7.2.7 Pathway顯著性富
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