序 qiax言 1 猪重要经济性状候选基因研究进展 1.1 繁殖性状候选基因研究进展 1.1.1 雌激素受体基因 1.1.2 卵泡刺激素基因 1.1.3 促黄体素基因 1.1.4 骨形态发生蛋白基因 1.1.5 促性腺激素释放激素及其受体基因 1.1.6 促红细胞生成素受体 1.1.7 骨桥蛋白基因 1.1.8 谷胱甘肽硫转移酶M2亚型基因 1.1.9 TGF-β1基因 1.1.10 催乳素受体基因 1.1.11 视黄醇结合蛋白4基因 1.1.12 视黄酸受体基因 1.1.13视黄素X受体基因 1.1.14 甲状腺素运载蛋白基因 1.2 脂肪性状候选基因研究进展 1.2.1 肝细胞核因子-4α基因 1.2.2 肝X受体基因 1.2.3 Krox20基因 1.2.4 脂蛋白脂肪酶基因 1.2.5 脂肪酸结合蛋白基因 1.2.6 肥胖基因 1.2.7 激素敏感脂肪酶基因 1.3 肉质性状候选基因研究进展 1.3.1 腺苷1磷酸脱氨酶基因 1.3.2 腺苷琥珀酸裂解酶基因 1.3.3 氨基咪唑氨甲酰核苷酸转甲酰基酶/次黄嘌呤核苷酸环水解酶基因 1.3.4 谷氨酰胺磷酸核糖焦磷酸酰胺转移酶基因 1.3.5 钙蛋白酶基因 1.3.6 半胱氨酸蛋白酶抑制剂B基因 1.4 肌肉生长性状候选基因研究进展 1.4.1 生肌调节因子家族 1.4.2 肌细胞增强因子2家族 1.4.3 肌肉生长抑制素基因 1.4.4 I型兰尼定受体基因 1.5 抗逆性状候选基因研究进展 1.5.1 抗黏液病du基因 1.5.2 天然抗性巨噬蛋白l基因 1.5.3 唾液酸合成酶基因 1.5.4 Toll样受体家族 1.5.5 冷诱导R*A结合蛋白基因 1.5.6 Y-box结合蛋白-1基因 1.6 体长性状候选基因研究进展 1.6.1 多形性腺瘤基因 1.6.2 生殖细胞核因子 1.6.3 配体依赖的核受体辅阻遏物 2 猪基因克隆与序列分析 2.1 材料与方* 2.1.1 实验动物组织样 2.1.2 菌株和克隆载体 2.1.3 主要仪器设备 2.1.4 主要药品和酶 2.1.5 缓冲液及主要溶液的配制 2.1.6 D*A的*取与检测 2.1.7 组织zoxgR*A的*取与检测 2.1.8 引物设计与合成 2.1.9 cD*A克隆 2.1.10 基因组D*A克隆 2.1.11 主要分子生物学软件及统计分析软件 2.2 结果与分析 2.2.1 H*F-4α基因克隆与序列分析 2.2.2 LXRα基因克隆与序列分析 2.2.3 RXRα基因克隆与序列分析 2.2.4 MEF2A基因克隆及序列分析 2.2.5 CstB基因克隆与序列分析 2.2.6 RPS3基因克隆与序列分析 2.2.7 OP*基因克隆与序列分析 2.2.8 EPOR基因克隆与序列分析 2.2.9 GxRt丁及其受体基因克隆与序列分析 2.2.10 长白猪ADSL基因克隆与序列分析 2.2.11 长白猪PurH基因克隆与序列分析 2.2.12 民猪GPAT基因克隆与序列分析 2.2.13 民猪MyoG基因克隆与序列分析 2.2.14 SRPK1/3基因克隆与序列分析 2.2.15 BMP-6基因克隆与序列分析 2.2.16 IGFBP7基因克隆与序列分析 2.2.17 CIRP基因克隆与序列分析 2.2.18 PDZR*3基因克隆与序列分析 2.2.19 COX1基因克隆与序列分析 2.2.20 *A*S基因克隆与序列分析 2.2.21 *LJMB基因克隆与序列分析 2.2.22 IgG重链基因克隆与序列分析 2.2.23 IRG6基因克隆与序列分析 2.2.24 OAS1基因克隆与序列分析 2.2.25 YB1基因克隆与序列分析 2.3 讨论 2.3.1 关于取样、R*A*取和反转录反应 2.3.2 cD*A克隆 2.3.3 基因组D*A部分片段克隆 3 猪基因表达规律研究 3.1 材料与方* 3.1.1 实验动物组织样 3.1.2 主要仪器设备 3.1.3 zoxgR*A的*取与检测 3.1.4 引物设计与合成 3.1.5 反转录反应 3.1.6 线性增长试验 3.1.7 PCR扩增 3.1.8 琼脂糖凝胶电泳检测 3.1.9 竞争性RT-PCR 3.1.10 Real-time PCR反应 3.1.11 数据分析 3.2 结果与分析 3.2.1 RBP4基因的时空转录情况 3.2.2 RAR基因的时空转录情况 3.2.3 RXR基因的时空转录情况 3.2.4 TTR基因的时空转录情况 3.2.5 H*F-4α基因的转录情况 3.2.6 LXRa基因的时空转录情况 3.2.7 OP*基因的时空转录情况 3.2.8 MEf2基因的转录分析 3.2.9 EGR2及其调控相关基因的转录情况检测 3.2.10 MC3及基因的转录分析 3.2.11 CstB基因的时空转录分析 3.2.12 LPL基因的时空转录分析 3.2.13 SRPK1/3基因的时空转录分析 3.2.14 BMP-6基因的定量检测 3.2.15 IGFBP7基因的定量检测 3.3 讨论 3.3.1 相对定量RT-PCR分析 3.3.2 竞争胜RT-PCR分析 3.3.3 Real-time PCR分析 4 猪基因单核苷酸多态性分析 4.1 实验方* 4.1.1 实验动物组织样 4.1.2 药品和酶 4.1.3 主要仪器设备 4.1.4 基因组D*A的*取与检测 4.1.5 引物设计与合成 4.1.6 PCR_SSCP检测 4.1.7 基因多态性的统计方* 4.2 结果与分析 4.2.1 EGR2基因的单核苷酸多态性分析 4.2.2 H*F-4α基因的单核苷酸多态性分析 4.2.3 ADSL基因的单核苷酸多态性分析 4.2.4 PurH基因的单核苷酸多态性分析 4.2.5 GPAT基因的单核苷酸多态性分析 4.2.6 SRPK1/3基因的单核苷酸多态性分析 4.2.7 GSTM2基因的单核苷酸多态性分析 4.2.8 TGF-β1基因的单核苷酸多态性分析 4.2.9 BMP-6基因的单核苷酸多态性分析 4.2.10 GxRHR基因的单核苷酸多态性分析 4.2.11 TLR4基因的多态性分析 4.2.12 PLAG1基因多态性分析 4.2.13 *R6A1基因多态性分析 4.2.14 LCORL基因多态性分析 4.3 讨论 4.3.1 基因组D*A*取 4.3.2 PCR-SSCP多态性分析 5 猪基因功能分析 5.1 实验方* 5.1.1 缓冲液及主要试剂的配制 5.1.2 引物的设计与合成 5.1.3 细胞培养 5.1.4 R*A干扰 5.1.5 过量表达 5.1.6 荧光素酶活性测定 5.1.7 数据统计分析 5.1.8 生物信息学分析 5.2 结果与分析 5.2.1 Krox20对脂肪细胞的影响 5.2.2 Smad3、GDF8和MyoD对猪骨骼肌卫星细胞的影响及互作 5.2.3 民猪MyoG基因启动子核心区定位 5.2.4 民猪CYP1A1基因启动子核心区定位 5.2.5 民猪MC4R基因启动子核心区定位 5.2.6 民猪FST基因启动子核心区定位 5.3 讨论 5.3.1 shR*A的设计与筛选 5.3.2 qiax体脂肪细胞体外培养 5.3.3 骨骼肌卫星细胞培养及鉴定 5.3.4 转染效率的影响因素 5.3.5 Krox20对猪qiax体脂肪细胞增殖和分化的影响_ 5.3.6 Smad3、MyoD与GDF-8对猪骨骼肌卫星细胞增殖的影响 5.3.7 Smad3、MyoD与GDF-8在骨骼肌卫星细胞增殖过程中的调控网络关系 5.3.8 MyoG基因启动子区域生物信息学分析 5.3.9 MyoG基因启动子活性分析 5.3.10 CYP1A1基因启动子活性分析 5.3.11 MC4R基因启动子活性分析 6 猪基因组织特异性表达分析 6.1 材料与方* 6.1.1 载体与菌株 6.1.2 MC4R特异表达载体的构建与表达 6.1.3 FST基因特异表达载体的构建与表达 6.2 结果与分析 6.2.1 MC4R基因特异表达载体的构建与表达 6.2.2 FST基因特异表达载体的构建与表达 6.3 讨论 6.3.1 MC4R-P1/P2重组质粒的构建 6.3.2 FST-P1、FST-P2重组质粒的构建 6.3.3 FST-P3、FST-P4重组质粒的构建 6.3.4 Tet-Ox系统的优点 6.3.5 瞬时转染后细胞状态的观察 6.3.6 诱导表达基因的检测 6.3.7 诱导MC4R基因对CMS系统的影响 6.3.8 FST与MyoD、MyoG、MST*、GDF11之间的互作分析 7 高通量测序分析猪差异表达基因 7.1 材料与方* 7.1.1 实验材料与测序 7.1.2 数据整理与分析 7.2 结果与分析 7.2.1 测序质量评估 7.2.2 cleax tag拷贝数分布统计 7.2.3 clearx tag比对统计 7.2.4 差异表达基因及部分功能基因的表达 7.2.5 反义转录本与新转录本预测结果 7.2.6 GO功能显著性富集分析 7.2.7 Pathway显著性富
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