生物信息學學習指導及習題集(八年製配教) pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

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李霞，李亦學 編

圖書標籤:

• 生物信息學
• 八年製
• 醫學教育
• 學習指導
• 習題集
• 生物技術
• 分子生物學
• 基因組學
• 計算生物學
• 醫學信息學

齣版社： 人民衛生齣版社

ISBN：9787117222389

版次：2

商品編碼：11937086

包裝：平裝

開本：16開

齣版時間：2016-04-01

用紙：膠版紙

頁數：134

字數：230000

內容簡介

　　李霞、李亦學主編的《生物信息學學習指導及習題集》第2版是“十二五”普通高等教育本科規劃教材《生物信息學》第2版的配套教材。各章與主教材保持一緻，閤並第1版“雙序列比對”、“多序列比對”兩章為“序列比對”；閤並第1版“序列特徵分析”、“錶達序列分析”兩章為“序列特徵分析”；閤並第1版“蛋白質分析與蛋白質組學”、“蛋白質結構分析”兩章為“蛋白質組與蛋白質結構分析”；新增非編碼RNA與復雜疾病的生物信息學研究、新一代測序、“組學”研究等前沿熱點。每一章包含學習目標、知識要點、復習思考題和參考答案與題解，內容全麵，重點突齣。旨在於幫助學生在理論學習基礎上，增強實踐運用能力，自測學習效果。本書適閤學生同步復習、準備課程考試及準備執業醫師考試等。

目錄

第一章 生物序列資源
學習目標
知識要點
一、引言
二、NCBI數據庫與數據資源
三、LICSC基因組瀏覽器與數據資源
四、EMBL-EBI數據庫與數據資源
五、重要的非編碼基因數據庫
復習思考題
一、名詞解釋
二、問答題
答案與題解
第二章 序列比對
學習目標
知識要點
一、引言
二、比對算法概要
三、數據庫搜索
四、比對軟件、參數與數據資源
五、比對技術的發展
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第三章 序列特徵分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、DNA序列特徵分析
三、蛋白質序列特徵分析
四、RNA序列與結構特徵分析
五、錶達序列特徵分析
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第四章 分子進化分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、係統發生樹分析與重建
三、核苷酸和蛋白質的適應性進化
四、分子進化與生物信息學
復習思考題
一、選擇題
二、問答題
三、計算題
答案與題解
第五章 基因芯片數據分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、基因錶達的測定平颱、數據庫
三、數據的預處理、差異錶達分析
四、基因芯片數據的聚類或分類分析
五、基因錶達分析的常用軟件
復習思考題
一、選擇題
二、問答題
三、上機實踐
答案與題解
第六章 蛋白質組與蛋白質結構分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、蛋白質組數據的獲取與分析
三、蛋白質結構的預測
四、蛋白質結構數據庫
五、蛋白質功能分析
六、蛋白質結構異常與疾病
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第七章 基因注釋與功能分類
學習目標
知識要點
一、引言
二、基因注釋數據庫
三、基因集功能富集分析
四、基因功能預測
復習思考題
一、選擇題
二、問答題
三、上機實踐
答案與題解
第八章 轉錄調控的信息學分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、轉錄因子結閤位點的信息學預測方法
三、轉錄調控相關數據庫
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第九章 生物分子網絡和通路
學習目標
知識要點
一、生物分子網絡概述
二、生物分子網絡分析
三、生物分子網絡重構
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第十章 計算錶觀遺傳學
學習要點
內容要點
一、引言
二、基因組的DNA甲基化
三、組蛋白修飾的錶觀基因組
四、基因組印記
五、錶觀遺傳學數據庫和軟件
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
答案與題解
第十一章 復雜疾病的分子特徵與計算分析
學習目標
知識要點
一、引言
二、復雜疾病的分子特徵與數據資源
三、復雜疾病的遺傳易感與遺傳定位分析
四、常用的集成軟件工具
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第十二章 非編碼RNA與復雜疾病
學習目標
知識要點
一、miRNA的特點及作用機製
二、miRNA靶基因預測
三、IncRNA及作用機製
四、ncRNA主要數據資源
五、ncRNA多態性分析
六、利用ncRNA錶達譜研究復雜疾病
七、復雜疾病非編碼RNA的計算識彆
復習思考題
一、選擇題
二、問答題
三、上機實踐
答案與題解
第十三章 新一代測序技術與復雜疾病研究
學習目標
知識要點
一、引言
二、新一代測序技術概述
三、DNA測序技術及應用
四、RNA測序技術與數據分析
五、ChIP-seq技術原理及分析方法
六、新一代測序技術在其他領域應用
復習思考題
一、選擇題
二、名詞解釋
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解
第十四章 藥物生物信息學
學習目標
知識要點
一、引言
二、藥物靶標的信息學識彆
三、藥物基因組學及其臨床研究策略
四、藥物基因組相關生物信息資源
五、基於藥物基因組的個體化藥物治療
復習思考題
一、名詞解釋
二、選擇題
三、問答題
四、上機實踐
答案與題解

前言/序言

《生物信息學學習指導及習題集(八年製配教)》 內容簡介 本書旨在為生物信息學領域的初學者提供一套係統、全麵的學習指南和實踐練習。作為一本麵嚮八年製醫學本科生及相關專業學生的配教教材，它將生物信息學的基礎理論知識與實際應用緊密結閤，幫助讀者快速掌握該領域的關鍵概念、核心技術和研究方法。 一、 核心內容概述 本書共分為三個主要部分：基礎理論、常用工具與技術，以及實踐應用與案例分析。 第一部分：生物信息學基礎理論 本部分深入淺齣地介紹瞭生物信息學研究的基石，包括： 生物信息學的概念與發展曆程： 闡述生物信息學的定義、研究範疇、重要性以及在現代生命科學研究中的地位。迴顧其發展曆程，強調其跨學科的特點。 生命分子數據的基本類型與特徵： 詳細介紹基因組學、轉錄組學、蛋白質組學、代謝組學等主要組學數據的特點、來源和基本信息結構。解釋 DNA、RNA、蛋白質等生物大分子的序列、結構、功能等關鍵信息。 生物序列分析基礎： 講解生物序列（DNA、RNA、蛋白質）的基本概念，包括序列的錶示、堿基/氨基酸的編碼，以及對序列進行基本操作（如查找、比對、翻譯）的重要性。 生物數據庫： 介紹各類重要的生物數據庫，如 NCBI (GenBank, PubMed, RefSeq)、EBI (EMBL-EBI)、UniProt 等，以及它們在存儲、管理、檢索和共享生物分子數據方麵的作用。強調數據庫的分類、檢索策略和數據解讀。 生物信息學與相關學科的交叉： 探討生物信息學與分子生物學、遺傳學、生物化學、計算科學、統計學等學科之間的緊密聯係，以及多學科交叉在推動生命科學發展中的作用。 第二部分：常用工具與技術 本部分聚焦於生物信息學研究中廣泛使用的工具和技術，引導讀者瞭解並掌握如何利用它們解決實際問題： 序列比對工具： 詳細介紹局部比對（BLAST、PSI-BLAST）和全局比對（Needleman-Wunsch, Smith-Waterman）的原理、算法和應用場景。講解如何選擇閤適的比對工具和參數，以及如何解讀比對結果。 基因查找與預測： 介紹基因的查找方法，包括識彆開放閱讀框 (ORF)、利用基因結構模型進行預測等。講解基因注釋的概念和重要性。 多序列比對與係統發生分析： 講解多序列比對（如 ClustalW, MUSCLE）在研究序列保守性、進化關係等方麵的應用。介紹係統發生樹的構建原理、方法（如最大簡約法、最大似然法、貝葉斯法）和解讀。 蛋白質結構與功能分析： 介紹蛋白質三維結構的預測（同源建模、從頭預測）、比對和分析方法。講解蛋白質功能域、信號肽、跨膜區等結構特徵的預測，以及蛋白質-蛋白質互作網絡的分析。 基因組學與轉錄組學常用分析： 介紹基因組測序技術的概述，以及基因組組裝、基因注釋、單核苷酸多態性 (SNP) 檢測等基本分析流程。講解 RNA-Seq 數據的處理流程，包括比對、定量、差異錶達分析等。 生物信息學編程與腳本語言基礎： 介紹 Per-l、Python、R 等在生物信息學中常用的腳本語言，以及如何利用它們進行數據處理、自動化分析和結果可視化。 第三部分：實踐應用與案例分析 本部分通過具體的研究實例，將前兩部分所學的理論知識和技術方法付諸實踐，幫助讀者提升解決實際問題的能力： 文獻檢索與信息獲取： 指導讀者如何有效地利用 PubMed 等數據庫進行生物醫學文獻檢索，以及如何從文獻中提取關鍵的生物信息學數據和研究思路。 基因功能預測案例： 以某個特定基因為例，演示如何利用 BLAST、UniProt 等工具查詢基因序列和已知信息，如何通過同源比對推測其潛在功能，並結閤文獻進行驗證。 蛋白質結構與功能分析案例： 分析一個已知蛋白質的序列，演示如何預測其二級結構、三維結構，以及如何通過結構比對查找同源蛋白，推測其在生物過程中的作用。 基因組學數據分析案例： 模擬一個簡單的基因組測序數據分析流程，例如查找一個已知基因在某個新測序基因組中的位置，或識彆其中的一些突變位點。 轉錄組學數據分析案例： 以某個疾病樣本和正常對照樣本為例，演示如何進行差異錶達基因的分析，從而發現與疾病發生發展相關的基因。 生物信息學在臨床醫學中的應用： 介紹基因測序在遺傳病診斷、癌癥研究、個性化醫療等方麵的應用。探討生物信息學如何輔助疾病的早期診斷、預後評估和藥物研發。 研究方法與倫理討論： 引導讀者思考生物信息學研究中的常見問題，如何設計閤理的實驗方案，如何評估分析結果的可靠性，以及關注數據隱私和信息安全等倫理問題。 二、 學習指導與習題設計 本書的“學習指導”部分將為每一章提供明確的學習目標、重點難點解析、學習路徑建議以及推薦的參考資源。 “習題集”部分則精心設計瞭大量涵蓋理論理解和實踐操作的習題。習題類型多樣，包括： 概念辨析題： 考察對生物信息學基本概念、術語的掌握程度。 計算與分析題： 要求讀者利用給定的序列或數據，運用所學工具和方法進行實際計算和分析。 案例分析題： 提供真實的生物學研究場景，要求讀者設計分析方案，解釋分析結果，並提齣可能的生物學推論。 編程練習題： 鼓勵讀者動手編寫簡單的腳本程序，實現數據處理或自動化分析任務。 討論題： 引導讀者思考生物信息學研究的意義、局限性以及未來發展方嚮。 三、 適用對象 本書特彆適閤以下讀者： 八年製醫學本科生： 作為臨床醫學專業學習生物信息學的基礎教材和輔助讀物，幫助其理解現代醫學研究中的大數據分析方法。 生命科學、生物技術、藥學等相關專業學生： 學習生物信息學基礎知識和應用技能，為後續的專業學習和研究打下堅實基礎。 對生物信息學感興趣的科研人員和技術人員： 作為入門和進階的學習資源，快速掌握常用工具和技術。 通過本書的學習，讀者將能夠建立起紮實的生物信息學理論基礎，熟練掌握常用的分析工具和技術，並初步具備運用生物信息學方法解決實際生物學問題的能力，為未來在生命科學、醫學等領域的深入研究和創新奠定堅實的基礎。

評分☆☆☆☆☆

這本書在排版設計和印刷質量上也屬上乘。整體風格簡潔明快，重點突齣，閱讀起來非常舒適。紙張的選擇也很好，厚實且不易反光，長時間閱讀也不會感到眼睛疲勞。一些關鍵的公式和圖錶都采用瞭醒目的排版方式，方便我們快速抓住核心信息。 而且，書中的插圖和圖錶都非常精美且具有很強的示意性。它們不僅僅是為瞭美觀，更是為瞭幫助我們理解抽象的概念。例如，在講解DNA測序原理的章節，書中繪製瞭一係列精細的示意圖，清晰地展示瞭不同測序技術的原理和流程。在講解序列比對算法時，書中也運用瞭錶格和流程圖，使得算法的邏輯更加清晰可見。這些高質量的圖文並茂的設計，極大地提升瞭我的閱讀體驗，也讓學習過程更加高效。

評分☆☆☆☆☆

《生物信息學學習指導及習題集(八年製配教)》這本書，在編排上可以說是匠心獨運。每一章節都由“概念解析”、“關鍵工具介紹”、“實際操作演示”和“習題與解析”四個部分組成，構成瞭一個完整的學習閉環。這種結構設計，充分考慮瞭我們學生的學習習慣和認知規律。首先，概念解析部分清晰易懂，能夠幫助我們快速掌握核心知識點；接著，關鍵工具介紹部分則循循善誘地引導我們熟悉常用的生物信息學軟件和數據庫，避免瞭我們在麵對繁雜的工具時不知所措；實際操作演示部分更是手把手地教我們如何運用這些工具解決問題，將理論知識轉化為實際操作能力；最後，習題與解析部分則幫助我們鞏固所學，查漏補缺。 我尤其喜歡“實際操作演示”部分。它不是簡單地羅列幾個命令行，而是通過截圖和詳細的文字說明，一步步地演示如何完成一項生物信息學分析任務，比如如何從NCBI下載基因序列，如何使用BLAST進行序列比對，如何使用R語言進行基礎的數據可視化等等。這種“傻瓜式”的教學方式，極大地降低瞭我們學習生物信息學操作的門檻。對於初學者來說，最頭疼的往往是不知道如何開始，這本書的這一部分正好解決瞭這個問題，讓我們能夠自信地邁齣實踐的第一步。

評分☆☆☆☆☆

作為一名八年製的學生，我們接觸到的生物信息學內容是與臨床緊密結閤的。這本書在這方麵做得非常到位，它在講解理論知識的時候，都會穿插大量的臨床應用案例，讓我能夠清晰地看到生物信息學在疾病診斷、藥物研發、個體化醫療等領域的實際價值。比如，在講解SNP（單核苷酸多態性）分析時，書中不僅介紹瞭其在基因分型中的作用，還詳細分析瞭不同SNP位點與特定疾病（如心血管疾病、癌癥）的關聯性研究。 這種將理論與實際相結閤的方式，極大地激發瞭我學習生物信息學的興趣。我不再僅僅是為瞭應付考試而學習，而是真切地感受到這項技術對於未來醫學發展的重要性。書中的案例都來自於真實的研究，這讓我對生物信息學的應用前景有瞭更直觀的認識。每次閱讀案例，我都忍不住去思考，如果我們能夠更好地利用這些信息，是否就能更早地發現疾病，製定更有效的治療方案？這種思考過程，讓我覺得學習生物信息學是一件非常有意義的事情，也讓我對未來的醫學研究充滿瞭期待。

評分☆☆☆☆☆

這本書最大的亮點之一，在於它能夠將看似枯燥的生物信息學概念，通過生動形象的語言和精心設計的案例，變得鮮活有趣。我是一個對文字錶達比較敏感的人，如果一本書通篇都是乾巴巴的術語和公式，我很容易就會失去閱讀的興趣。而這本書，則完全沒有這個問題。它在講解每一個概念的時候，都會盡量使用通俗易懂的語言，並且善於運用比喻和類比，將復雜的原理形象化。 比如，在講解“同源性”和“相似性”的區彆時，書中用“錶兄弟”和“兄弟”來類比，非常直觀地解釋瞭兩者在遺傳演化關係上的差異。又比如，在講解“基因組數據庫”的作用時，書中將其比作一個巨大的“生命百科全書”，方便我們查找和研究各種生命信息。這種富有創意的講解方式，讓我覺得學習生物信息學不再是一件枯燥乏味的任務，而是一場充滿樂趣的探索之旅。它幫助我打破瞭對生物信息學的刻闆印象，讓我能夠更積極地投入到學習中。

評分☆☆☆☆☆

這本書的習題設計，非常注重培養學生的獨立思考能力和解決問題的能力。很多習題並不是簡單地套用公式就能解決的，而是需要我們結閤課本知識，進行一定的分析和推理。例如，有一道關於“變異檢測”的習題，它要求我們設計一個實驗方案，利用生物信息學工具來尋找某個特定基因上的罕見突變。 這道題就需要我們對基因組學、變異檢測算法以及數據庫知識有比較全麵的掌握，並且能夠將這些零散的知識點進行有效的整閤。在解答這類習題的過程中，我發現自己不僅加深瞭對知識的理解，更重要的是，我學會瞭如何將知識應用於解決實際問題。這種“學以緻用”的學習方式，讓我覺得非常充實和有價值。而且，習題的難度梯度設計也很閤理，既有鞏固基礎的題目，也有挑戰思維的難題，能夠滿足不同水平的讀者需求。

評分☆☆☆☆☆

這本《生物信息學學習指導及習題集(八年製配教)》真是太給力瞭！作為一名八年製醫學專業的學生，在接觸生物信息學這門新興學科的時候，簡直是如墜雲裏霧裏。課程內容本身就抽象且專業性極強，光聽老師講授，很多概念都隻能似懂非懂，更彆提那些復雜的算法和工具瞭。幸好，我找到瞭這本書。它不僅僅是一本“習題集”，更像是一位經驗豐富的老師，循循善誘地引導我一點點揭開生物信息學的神秘麵紗。 首先，它的“學習指導”部分做得極其齣色。我特彆喜歡它將復雜的概念拆解成易於理解的單元，並配以大量的類比和圖示，這對於我這種需要將抽象理論與實際應用相結閤的學習者來說，簡直是救命稻草。比如，在講解序列比對的原理時，書中並沒有直接堆砌數學公式，而是先用一個生動的生活場景（比如找尋相似的麯譜）來類比，再逐步引齣Needleman-Wunsch和Smith-Waterman算法的核心思想。這種由淺入深、由易到難的講解方式，讓我覺得生物信息學並沒有想象中那麼難以逾越。而且，它還非常貼心地提示瞭各個章節的學習重點和難點，讓我能夠有的放矢地投入精力，避免走彎路。

評分☆☆☆☆☆

這本書在內容的廣度和深度上都做得相當齣色。它涵蓋瞭生物信息學領域最核心、最前沿的知識，從基礎的序列分析、蛋白質結構預測，到復雜的基因組學、轉錄組學、蛋白質組學數據分析，幾乎無所不包。而且，它並非淺嘗輒止，而是對每一個主題都進行瞭深入的探討，既有理論的高度，又有實踐的維度。我特彆欣賞書中對一些前沿研究方嚮的介紹，比如宏基因組學、單細胞測序數據分析等，這些內容對於我們未來從事相關領域的研究非常有啓發意義。 在講解基因組學部分，書中不僅介紹瞭基因組測序技術的發展曆程，還詳細闡述瞭基因組組裝、基因識彆、變異檢測等關鍵技術。更重要的是，它還將這些技術與具體的生物學問題相結閤，比如如何通過基因組分析來研究物種的進化關係，如何利用基因組信息來診斷遺傳性疾病。這些內容不僅拓展瞭我的知識視野，也讓我對基因組學這門學科有瞭更深刻的認識。它不再僅僅是冷冰冰的數據和算法，而是蘊含著生命奧秘的鑰匙。

評分☆☆☆☆☆

這本書的習題部分，更是我學習路上的“磨刀石”。很多習題都設計得非常巧妙，能夠有效地檢驗我對理論知識的掌握程度，並促使我思考更深層次的問題。我印象最深的是一道關於基因組注釋的習題，它要求我們利用已有的數據庫和工具，對一個未知序列進行功能預測。這道題不僅僅是知識點的簡單應用，更考驗瞭我的信息檢索能力、邏輯分析能力以及綜閤運用多種工具解決實際問題的能力。在做題過程中，我遇到瞭不少睏難，但每次在仔細閱讀解析之後，都會豁然開朗，感覺自己又攻剋瞭一個小難關。 最讓我驚喜的是，這本書的解析部分不僅僅是給齣答案，而是詳細地闡述瞭解題思路和步驟，甚至還會講解一些在解題過程中可能遇到的陷阱和注意事項。這種“授人以漁”的教育理念，讓我覺得這本書不僅僅是在教我如何做題，更是在教我如何學習生物信息學。而且，習題的難度分布也很閤理，從基礎概念的鞏固，到復雜算法的應用，再到實際生物信息學項目的模擬，循序漸進，讓我能夠一步步地提升自己的能力。每次完成一套習題，我都會有一種成就感，也更加堅定瞭繼續深入學習的信心。

評分☆☆☆☆☆

對於八年製醫學生來說，掌握一定的生物信息學技能，是未來從事臨床研究和個性化醫療的必備素質。這本書恰恰滿足瞭我們的這一需求。它不僅僅提供瞭理論知識，更重要的是，它教會瞭我們如何實際操作。書中提供的許多例子都非常貼閤臨床應用，例如如何利用基因芯片數據來預測藥物反應，如何通過生物信息學方法來分析病原體的耐藥性基因，如何進行腫瘤基因組學的分析以指導臨床治療等等。 我尤其喜歡書中關於“藥物基因組學”的章節。它詳細介紹瞭如何根據個體的基因組信息來選擇最適閤的藥物和劑量，從而提高療效並減少不良反應。這讓我真切地感受到瞭生物信息學在實現“個體化醫療”方麵的巨大潛力。我開始思考，未來在臨床工作中，我們是否可以通過生物信息學分析，為每一位患者量身定製最 optimal 的治療方案？這本書點燃瞭我對未來醫學的憧憬，也讓我更加堅定瞭要學好生物信息學的決心。

評分☆☆☆☆☆

這本書的語言風格非常貼閤學生使用習慣，沒有過於晦澀難懂的學術術語堆砌，而是力求清晰、簡潔、易於理解。即便是在講解一些復雜的算法和理論時，作者也盡量使用通俗易懂的語言，並輔以大量的例子和比喻，使得我們這些初學者能夠快速地掌握核心概念。 我特彆喜歡書中在介紹一些新興技術或者研究熱點時，所展現齣的那種熱情和前瞻性。它不僅僅是在傳遞知識，更是在激發我們對生物信息學領域的興趣，讓我們看到這個學科的無限可能。這種充滿激情的寫作風格，讓我覺得作者真的是一位非常用心的老師，他不僅希望我們學會生物信息學，更希望我們能夠熱愛上這門學科。這種“溫度”在很多學術教材中是難能可貴的，它讓我覺得學習過程是充滿活力的。

評分☆☆☆☆☆

屬於智慧眾籌，也屬於禮花怒放，很具閃光點，很有啓迪

評分☆☆☆☆☆

給孩子買來看的，質量還挺好的，就是價格

評分☆☆☆☆☆

特彆好，上課用得著，贊一個，配套的書本

評分☆☆☆☆☆

給孩子買來看的，質量還挺好的，就是價格

評分☆☆☆☆☆

不錯

評分☆☆☆☆☆

屬於智慧眾籌，也屬於禮花怒放，很具閃光點，很有啓迪

評分☆☆☆☆☆

嗯，配套的

評分☆☆☆☆☆

特彆好，上課用得著，贊一個，配套的書本

評分☆☆☆☆☆

給孩子買來看的，質量還挺好的，就是價格