具体描述
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| 后基因组时代鱼类样本库建设与实践 | ||
| 曾用价 | 88.00 | |
| 出版社 | 科学出版社 | |
| 版次 | 1 | |
| 出版时间 | 2017年01月 | |
| 开本 | 16开 | |
| 作者 | 孙颖，石琼 编 | |
| 装帧 | 平装 | |
| 页数 | 190 | |
| 字数 | 282000 | |
| ISBN编码 | 9787030511690 | |
内容介绍
《华大基因-国家基因库系列：后基因组时代鱼类样本库建设与实践》围绕鱼类样本库建设这个中心论点，回答为什么（鱼类种质资源保存和利用）、现状如何（国内外现状及现今的挑战和机遇）、怎样做（标准规范和实践）、怎么用（配套数据库）等几个关键性问题，囊括鱼类样本库建设的几乎所有内容，阐述相关的生命伦理、质量控制、标准规范等重点论题，并且从鱼类样本的采集、处理、储存到基于样本的核酸提取、序列分析等均有详细的说明和指导，同时介绍鱼类样本库配套的生物信息数据库建设及模块化解决方案，让读者对鱼类样本库建设有一个全面而深入的认识。
作为“华大基因·国家基因库系列”丛书中的一本，《华大基因-国家基因库系列：后基因组时代鱼类样本库建设与实践》可作为深圳华大基因学院的研究生教材，也可供动物学、水生生物学、鱼类学有关专业的高年级本科生、研究生及从事生物样本库和信息数据库建设的相关学者参考使用。
目录
前言
第*部分 鱼类种质资源概述
第*章 我国主要水域的鱼类资源现状
第二章 鱼类种质资源面临的主要问题及对策
第三章 鱼类种质资源的应用前景
第二部分 鱼类样本库建设沿革与发展现状
第*章 生物样本库概述
第二章 传统鱼类样本库的建设概况
第三章 后基因组时代鱼类样本库面临的挑战
第四章 下一代测序技术催生组学级别的样本库建设
第五章 组学级别鱼类样本库的建设概况及展望
第三部分 鱼类样本库建设标准规范及zui佳实践
第*章 伦理道德规范
第二章 样本库机构设置和人员培训
第三章 标准规范制定
第四章 鱼类样本采集规范
第五章 鱼类样本解剖规范
第六章 样本前处理
第七章 样本制备
第八章 样本储存
第九章 样本出入库管理
第十章 样本包装和运输
第十一章 质量控制
第十二章 文件控制
第十三章 仪器管理维护
第十四章 安全管理
第四部分 配套生物信息数据库建设
第*章 生物信息数据库
第二章 国内外鱼类信息数据库
第三章 千种鱼转录组数据库及网站建设
第五部分 模块化解决方案
第*章 样本野外采集模块
第二章 运输模块
第三章 样本库模块
第四章 鱼类精子冷冻保存模块
第五章 基因组学模块
第六部分 依托Fish-TIK项目建设的鱼类样本库和数据库
第*章 Fish-TIK项目简介
第二章 标准操作规程
第三章 Fish-TIK当前进展
第四章 Fish-TIK样本库及数据库的应用及展望
附录1 表格表单
附录2 词汇表
在线试读
《华大基因-国家基因库系列：后基因组时代鱼类样本库建设与实践》：
第三章 标准规范制定
1 制定标准规范的目的和意义
随着生命科学研究进入后基因组时代，我国在鱼类基因组研究方面所产生的数据信息也进入了急剧膨胀阶段。但是，在鱼类组织样本收集、保存、利用等方面尚存在诸多问题，如缺乏标准化、规范化、规模化管理和质量控制等，使得已收集保存的鱼类组织未充分发挥应有的作用。此外，目前在鱼类研究方面，权**的、国**的信息共享平台较为稀缺，各数据库产生的数据关联程度低、整合性差，资源无法共享，在一定程度上阻碍了重大课题之间的合作和交流。
因此，我们拟订此标准规范，供各鱼类样本库建设单位参考与借鉴，期望能有助于储存和管理我国特有的鱼类遗传资源、生物信息和基因数据，为中国生命科学研究和产业发展提供基础性和公益性服务平台。该标准拟建设的样本库将区别于传统的、小规模鱼类样本库，将采用鱼类基因信息数据库（简称“干库”）和鱼类样本资源库（简称“湿库”）相结合的模式。“干库”汇集核酸和蛋白质数据信息，“湿库”收集、整合各类水生生物资源，包括鱼类标本、组织、活体细胞等，并保存实体的DNA、RNA、蛋白质和小分子样本等。这种既有数据又有实体的新一代基因资源库、信息库、知识库和工具库，与传统的“干湿分离”的基因库相比，具有极大的产业和科研应用价值与极强的竞争优势。
本套标准根据实践经验总结，为样本的规范化采集、储存、运输等提供了很好的依据。标准的制定和实施可帮助样本库提高其整体绩效和能力，为组织的所有者、顾客、员工、供方、合作伙伴和社会创造价值，有助于获得长期的市场成功，并使各类样本库易于在质量管理实践方面进行沟通和共享。
2 制定标准的基本原理
中国标准化原理探讨出现了多种观点，相互之间虽各有差异，但大家普遍认为“统一”“简化”“优选”“协调”为标准化的基本原理。邝兵等通过总结标准化的传统理论和现代标准化的发展趋势，认为标准化的方法原理是简化节约原理、统一效能原理、协调一致原理、总体zui优原理、有效竞争原理。下面分别介绍。
2.1 简化节约原理
桑德斯和松浦四郎关于标准化原理的论述中，均将简化看成标准化首要的和基本的原理。标准化的规律表明，简化是标准化zui基本的手段，通过标准化可以减少需要标准化对象的复杂性，加强互联互通和兼容性。然而同时需要注意，简化的实质不是简单化而是精练化，其结果不是单纯的以少替多，而是在一定合理性的范围内，以少胜多。
2.2 统一效能原理
标准化的目的是要使复杂的事物达到统一，通过统一实现结构的优化，从而实现zui佳的经济和社会效能。以保证事物发展所必需的秩序和效率为目的，对事物的形成、功能或其他特性，确定适合于一定时期和一定条件的一致规范，并使这种一致规范与被取代的对象在功能上达到等效。
2.3 协调一致原理
在标准系统中每一项标准都是一个基本的组成单元，它一方面要受到系统的制约，同时又会影响整个系统功能的发挥。协调一致原理就是为了使标准的整体功能达到zui佳，并产生实际效果，必须通过有效的方式协调好系统内外相关因素之间的关系，确定为建立和保持相互一致，适应或平衡关系所必须具备的条件。
2.4 总体zui优原理
按照特定的目标，在一定的限制条件下，对标准系统的构成因素及其关系进行选择、设计或调整，使其达到zui理想的效果，这样的标准化原理称为zui优化原理。在标准化的过程中，“总体zui优”的思想十分重要。一方面，因为追求zui优化有助于实现zui佳效益，这符合标准化的结果要求。另一方面，标准化活动的zui优化，应从整体出发，如果只是从局部出发，虽然貌似合理，但从总体上说，制定的标准其适应性一定十分有限。
2.5 有效竞争原理
标准化的作用不仅是产品的简化与节约、目标的统一与效能、过程的协调与一致、功能的总体与优化，还在于发挥市场竞争中的行业准入规则作用。这正是经济全球化下，标准化战略作用的具体体现。首先，在市场经济条件下，标准化已成为市场竞争的有效手段。标准的所有权意味着行业准入的规则和市场竞争的主动权，制定标准时，应重视话语权的争夺。其次，要合理运用国际国内标准化的规则，积极参与标准的制定，通过组成标准联盟等形式实现标准的联系与推广，争取更广泛的支持，使标准的制定和实施更多地反映自身的利益。zui后，标准在竞争中的作用必须体现出有效性。其含义是通过制定标准能使国家、产业和企业抢占竞争的制高点，获得应有的利益。
……
用户评价
这本书如同一扇窗，让我窥见了后基因组时代鱼类研究的壮丽图景。《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》并非一本简单的技术手册，而是作者对鱼类生命科学未来发展方向的深刻洞察与系统规划。书中关于基因组学在理解鱼类进化、适应性演化以及物种形成等方面的应用，描绘了一幅令人振奋的蓝图。在样本库的建设方面，作者展现了其在实践中的深厚功底。从样本采集的标准化流程，到不同保存方法的选择与优化，再到信息化的数据管理系统，每一个环节都经过了严谨的考量和精心的设计。我尤其被书中关于样本库互联互通的理念所打动，作者提出了构建全球性鱼类样本库网络，实现资源共享和协同研究的设想，这无疑将极大地推动鱼类科学的整体发展。书中关于样本库的长期维护和更新机制的讨论，也为样本库的可持续发展提供了切实可行的方案。作者的写作风格严谨而充满激情，字里行间都透露出对科学事业的无比热爱。这本书的价值，在于它不仅提供了方法，更激发了我们对科学探索的无限热情。
评分《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》是一部集科学性、实践性和前瞻性于一体的优秀著作。作者以其严谨的治学态度和深厚的专业知识，系统地阐述了后基因组时代鱼类研究的核心内容，并为样本库的建设提供了全面的指导。书中关于基因组学在鱼类遗传育种、疾病防控以及生物技术开发等方面的应用，描绘了令人期待的未来图景。在样本库的建设过程中，作者深入探讨了从样本的采集、分型，到质量控制、信息管理，再到数据挖掘和应用等各个环节。我被书中关于建立标准化样本采集规范和质量控制体系的详细论述所吸引，这对于保证样本数据的准确性和可靠性至关重要。书中关于样本库的国际化发展和资源共享的理念，也为推动全球鱼类科学研究的合作提供了重要的方向。作者的语言风格朴实而生动，将复杂的科学知识娓娓道来，充满了感染力。这本书的问世，将有力地推动我国在鱼类研究领域的科技创新和国际竞争力。
评分这部《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》犹如一本科学探索的指南针，为我们指明了鱼类研究的新方向。作者并非简单地罗列技术细节，而是以一种启发性的方式，引导读者理解后基因组时代对于鱼类科学研究带来的深刻变革。书中对基因组学在解开鱼类生命奥秘、理解物种多样性以及应对环境挑战等方面的潜力进行了深入的挖掘。在样本库的建设方面，作者展现了其在实践中的非凡智慧。从样本的采集流程、处理技术，到信息的存储、分析，再到数据的共享与利用，每一个环节都充满了创新和优化。我尤其被书中关于样本库在灾难性事件应对和物种保护中的作用所深深感动，这让我看到了科学研究的社会价值和人文关怀。书中关于样本库的长期可持续发展战略的探讨，也为我们提供了宝贵的启示。作者的文笔凝练而富有力量，将宏大的科学愿景与精细的实践操作完美地结合在一起。这本书不仅是一部学术专著，更是一份献给未来科学探索的礼物。
评分《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》是一部极具前瞻性和实践指导意义的著作。作者以其深厚的学术造诣和丰富的实践经验，为我们勾勒出了后基因组时代鱼类研究的宏伟蓝图，并为样本库的建设提供了系统性的解决方案。书中关于基因组学技术在鱼类疾病诊断、药物开发以及生态修复等方面的应用，让我看到了科学研究服务于社会发展的巨大潜力。在样本库的建设过程中，作者详细阐述了从样本的分类、鉴定，到质量控制、数据标准化，再到信息系统的构建与维护等一系列关键环节。我印象深刻的是书中关于生物信息学在样本库管理中的应用，作者介绍了如何利用先进的生物信息学工具，对海量的样本数据进行高效的处理、分析和可视化，从而最大化样本库的利用价值。书中关于样本库的国际合作与交流的探讨，也为我们提供了借鉴意义。作者的语言风格清晰流畅，逻辑严谨，使得复杂的科学内容易于理解和掌握。这本书为鱼类研究者提供了一个全面、深入的指导，将极大地促进该领域的科技进步。
评分阅读《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》的过程，是一次思维的深度碰撞。这本书并非一蹴而就的教科书，而是作者多年探索与实践的结晶，字里行间流淌着对科学的热情与执着。书中对于“后基因组时代”的定义，并非仅仅停留于基因测序的完成，而是强调了如何利用这些海量基因组数据，结合其他多组学信息，来更深入地理解鱼类生命活动的全貌。这让我深刻认识到，基因组学研究的真正价值，在于其指导下的应用。作者在阐述样本库建设时，将理论与实践紧密结合，详细描述了从实验室设计、仪器设备选择，到人员培训、管理流程制定等一系列具体步骤。我特别被书中关于样本追踪与溯源的章节所吸引，作者通过生动的案例，展示了如何利用先进的信息技术，构建一个能够精确记录每一个样本的来源、采集时间、处理过程、保存条件以及使用情况的数据库。这种精细化的管理，对于确保样本的质量和可信度至关重要。书中关于样本库的伦理考量，也让我有所触动，作者在保障数据安全、保护研究者权益、以及促进数据共享等方面，提出了许多值得借鉴的原则和方法。这让我看到，科学发展不仅需要技术创新，更需要人文关怀和社会责任。整本书的写作风格大气磅礴，又细致入微，仿佛一位经验丰富的向导，带领我在复杂的科学领域中探寻前行的道路。
评分这是一本令人耳目一新的著作。《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》以其独到的视角和深入的分析，在鱼类研究领域树立了新的标杆。书中对于“后基因组时代”的定义，并非简单地将基因组学视为终点，而是将其视为一个起点，一个通往更深层次理解生命奥秘的起点。作者强调了样本库在这一进程中的核心作用，它不仅是数据的宝库，更是连接过去、现在与未来的桥梁。在样本库的建设方面，作者展现了极高的专业性和实践经验。从样本的采集、处理、保存，到信息的记录、管理、共享，每一个环节都经过了精雕细琢。我被书中关于自动化和智能化样本库管理的章节所深深吸引，作者详细阐述了如何利用先进的机器人技术和人工智能算法，来提高样本的处理效率和数据的准确性。这种技术与科学的深度融合，让我看到了样本库建设的无限可能。书中对于样本库的评估与优化机制的讨论，也让我受益匪浅，作者提出了多种客观的评价指标，并给出了持续改进的建议。这让我认识到，一个优秀的样本库，并非一成不变，而是需要不断地进行评估和优化，以适应不断发展的科学需求。本书的语言风格流畅自然，逻辑清晰，使得复杂的科学概念也变得易于理解。
评分在翻阅《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》的过程中，我仿佛穿越到了一个充满未知与惊喜的科学前沿。这本书并非仅仅是冰冷的数据堆砌，而是将宏大的科学愿景与精细的实践操作巧妙地融合在一起。开篇就以一种引人入胜的方式，勾勒出了后基因组时代对鱼类研究带来的革命性变革。作者并没有直接抛出技术细节，而是先娓娓道来，阐述了基因组学技术如何在生物多样性保护、渔业可持续发展、以及疾病防控等多个领域打开了新的大门。我尤其对其中关于“样本库”概念的拓展感到新奇，它不再仅仅是冷冻的组织切片，而是包含了活体、细胞系、DNA、RNA，甚至是指纹信息等全方位的数据集合。书中详尽地解析了构建这样一个庞大而复杂的样本库所面临的挑战，从样本采集的标准化、保存条件的优化，到信息化的管理系统设计，每一个环节都经过了深思熟虑。我深刻体会到，一个成功的样本库，不仅仅是技术的结晶，更是科学家的远见卓识与严谨态度的体现。作者在描述样本采集过程时，对不同鱼类物种、不同生长阶段、不同地理区域的样本采集策略进行了深入剖析，这让我意识到，样本的代表性和多样性是样本库价值的核心所在。书中对于质量控制的重视，更是让我印象深刻，每一个环节的疏忽都可能导致整个样本库的价值大打折扣。这种对细节的极致追求，在学术著作中实属难得，也让我对作者的专业素养有了更深的敬意。整体而言，这本书为我打开了一个全新的视角，让我对鱼类研究的未来充满了期待。
评分《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》的问世，无疑为鱼类研究领域注入了新的活力。这本书的价值，远不止于技术层面的指导，更在于其宏观的视野和前瞻性的思考。作者并没有局限于已有的研究成果，而是大胆地展望了未来，勾画出了基因组学数据在解开鱼类生命奥秘、解决现实问题中的巨大潜力。在样本库建设方面，作者深入剖析了不同类型样本的特点及其适用的保存技术。无论是珍贵的DNA样本，还是对保存条件要求极高的RNA样本，亦或是需要长期维持活性的细胞系，书中都给出了详尽的解决方案。我尤其欣赏书中关于样本库可持续发展的探讨，作者提出了多种创新的资金筹措和运营模式，旨在确保样本库能够长期、稳定地运行，为未来的研究提供源源不断的资源。书中关于知识产权保护和数据共享机制的论述，也为样本库的健康发展提供了重要的理论支撑。作者的行文风格朴实而有力，没有华丽的辞藻，却字字珠玑，充满了科学家的严谨和智慧。阅读这本书，就像与一位睿智的长者对话，在汲取知识的同时，也收获了对科学事业的深刻理解。这本书为我打开了探索未知世界的大门，让我对未来的科研工作充满了信心。
评分《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》是一部融汇了前沿科学理论与扎实实践经验的鸿篇巨制。作者以其敏锐的洞察力，精准地把握了后基因组时代鱼类研究的发展脉络，并系统地阐述了样本库建设的重要意义和实践路径。书中对基因组学数据与其他生物学数据的整合，进行了深入的探讨，揭示了多组学数据融合在揭示鱼类复杂生命活动中的巨大潜力。在样本库的建设方面，作者从宏观的战略规划到微观的操作细节，都进行了详尽的阐述。我尤其对书中关于不同类型鱼类样本的特殊处理方法和保存策略感到惊叹。例如，对于一些对环境变化极其敏感的鱼类，作者提出了创新的低温保存技术；对于一些体型巨大的鱼类，作者则设计了高效便捷的样本采集流程。书中关于样本库的伦理、法律和政策方面的讨论，也为样本库的健康发展提供了重要的指导。作者的文笔犀利而富有条理，将深奥的科学问题阐述得通俗易懂，极具启发性。这本书不仅为科研人员提供了宝贵的实践经验，也为政策制定者和公众提供了一个了解鱼类研究前沿的窗口。
评分这是一本真正能够启迪思维的书籍。《后基因组时代鱼类样本库建设与实践》以其独特的视角，引领读者走进鱼类科学研究的新时代。作者并非仅仅陈述事实，而是通过深入的分析和独到的见解，揭示了后基因组时代所带来的挑战与机遇。书中对于基因组学在理解鱼类行为、生理以及生态适应性等方面的应用，提供了全新的思路。在样本库建设方面，作者展现了其在实践中的卓越能力。从样本的采集方法、保存条件，到信息的录入、检索，再到数据的共享与利用，每一个环节都经过了细致的推敲和优化。我尤其欣赏书中关于样本库的风险评估与管理策略的阐述，作者详细分析了可能出现的各种风险，并提供了相应的应对措施，确保样本库的安全与稳定运行。书中关于样本库的社会经济效益评估，也让我看到了科学研究的实际价值。作者的写作风格洒脱而富有洞察力，将宏大的科学概念与具体的实践操作巧妙地结合起来。这本书不仅为鱼类研究者提供了宝贵的经验，也为相关领域的决策者提供了重要的参考。
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