水产基因组学技术 pdf epub mobi txt 电子书 下载 2025

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[美] 刘占江 著

图书标签:

• 基因组学
• 水产
• 生物技术
• 分子生物学
• 遗传学
• 基因编辑
• 测序
• 生物信息学
• 育种
• 海洋科学

出版社： 化学工业出版社

ISBN：9787122097743

版次：1

商品编码：10614467

包装：平装

开本：16开

出版时间：2011-04-01

用纸：胶版纸

内容简介

　　《水产基因组学技术》云集了当前国际上从事水产动物基因组学研究的一线科学家，基于理论联系实际的原则，根据水产动物基因组的特点，详细介绍了基因组学各种技术及其原理，涵盖了水产动物基因组标记技术、基因组作图技术和全基因组测序技术等各个方面。
　　 　　《水产基因组学技术》极具适应性，可作为水产养殖、动物育种、海洋生物技术、生物学等专业的教学用书，更是从事分子育种、海洋生物技术等研究人员必备的工具书。

目录

第1章 基因组和基因组学的概念
第一篇 基因组标记
第2章 限制性片段长度多态性（RFLP）
第3章 随机扩增多态性DNA（RAPD）
第4章 扩增片段长度多态性（AFLP）
第5章 微卫星标记和标记效用的评价
第6章 单核苷酸多态性（SNP）
第7章 等位酶和线粒体DNA标记
第8章 水产养殖中基于个体的基因型分析方法
第9章 应用DNA标记进行群体遗传学分析
第二篇 基因组作图
第10章 水产生物的连锁作图
第11章 水产生物经济数量性状位点的检测与分析
第12章 水产生物的标记辅助选择
第13章 大片段细菌克隆文库的构建和应用
第14章 细菌人工染色体文库（BAC）为基础的水产基因组物理图的构建
第15章 利用BAC末端测序分析基因组物理特征
第16章 基因组概貌：基因组重复结构鉴定
第17章 应用荧光原位杂交分析基因组
第18章 水产生物的辐射性杂交作图
第19章 比较基因组学与定位克隆
第三篇 基因组表达与功能分析
第20章 基于表达序列标签的转录组分析
第21章 基因芯片技术的基础知识：基本原理及在水产养殖业中的应用
第22章 鲑鱼DNA芯片技术及其他用于功能基因组学研究的方法
第23章 水域环境基因组学相关的大型数据集分析的计算性挑战
第24章 功能基因组学233
第四篇 全基因组测序的前期准备
第25章 DNA测序技术
第26章 全基因组测序
第27章 生物信息学
第五篇 水产养殖动物基因组测序的特殊性
第28章 硬骨鱼类的重复基因组
第29章 双壳类基因组学：所面临的复杂性、挑战及展望
参考文献

探索细胞奥秘：从分子到生命的宏伟画卷 本书并非聚焦于某一特定领域的专业知识，而是致力于为读者展开一幅描绘生命物质基础的宏大画卷。我们将深入探索那些构成一切生命形式的微观构件，理解它们如何协同运作，编织出丰富多彩的生命世界。从最基本的遗传物质到复杂的蛋白质机器，再到细胞的精巧结构和动态过程，本书将带领您踏上一段引人入胜的科学之旅。 第一章：遗传物质的基石——DNA的秘密 我们将从构成所有生命遗传信息的DNA（脱氧核糖核酸）开始。这是一种令人惊叹的分子，其独特的双螺旋结构蕴藏着生命得以延续和繁衍的蓝图。本章将详细阐述DNA的化学组成，包括其基本单位——核苷酸（由磷酸、脱氧核糖和四种碱基组成：腺嘌呤A、鸟嘌呤G、胞嘧啶C和胸腺嘧啶T）。我们将深入剖析碱基配对规则（A与T配对，G与C配对），正是这种精确的配对机制保证了遗传信息的准确复制。 接着，我们将探讨DNA的结构特征，包括其方向性（5'端和3'端）以及两条链的反平行排列。理解DNA的结构是理解其功能的基础，我们将解释DNA是如何在细胞分裂过程中进行精确复制的，为下一代传递生命的密码。这一过程的复杂性和精确性，以及潜在的突变如何影响生命活动，都将是本章的重点。 此外，我们还将触及DNA的包装方式。在真核细胞中，DNA并非裸露存在，而是与组蛋白等蛋白质缠绕形成复杂的染色质结构，最终组织成高度有序的染色体。这种精妙的包装方式使得庞大的基因组能够在微小的细胞核中高效地容纳，并对基因的表达进行调控。我们将介绍不同层级的DNA包装，以及染色质重塑在基因可及性和表达中的作用。 第二章：编码生命的语言——基因与遗传密码 DNA序列并非随机排列，而是承载着指导蛋白质合成的遗传信息，这些信息单元被称为基因。本章将聚焦于基因的结构和功能，以及它们如何被读取和翻译。我们将详细介绍基因的组成，包括外显子（编码区）和内含子（非编码区）。 核心内容将围绕遗传密码展开。遗传密码是一种三联体密码，即三个核苷酸碱基编码一个氨基酸。我们将列举并解释遗传密码表的构成，理解哪些密码子编码哪些氨基酸，以及是否存在起始密码子（AUG）和终止密码子。遗传密码的通用性（在绝大多数生物体中相同）是一个重要的生命现象，我们将探讨其意义。 本章还将深入介绍基因表达的两个关键步骤：转录和翻译。转录是将DNA中的遗传信息复制到信使RNA（mRNA）分子的过程，我们将解释RNA聚合酶的作用以及mRNA的加工过程（如加帽、剪接和加尾）。翻译则是利用mRNA上的遗传密码，在核糖体上合成蛋白质的过程。我们将详细阐述核糖体在翻译中的作用，以及转运RNA（tRNA）如何携带氨基酸并识别mRNA上的密码子。这一精妙的分子机器如何将线性的核苷酸序列转化为具有特定三维结构和功能的蛋白质，是生命活动的核心机制。 第三章：蛋白质的多样性与功能 蛋白质是生命活动的主力军，它们以其惊人的多样性和广泛的功能，支撑着细胞的结构、催化生化反应、传递信号、运输物质等等。本章将深入探讨蛋白质的世界。 我们将首先解析蛋白质的组成单位——氨基酸。共有20种常见的氨基酸，它们各自具有独特的化学性质（如酸性、碱性、疏水性、亲水性），这些性质决定了蛋白质的最终结构和功能。我们将介绍氨基酸的结构（中心碳原子、氨基、羧基和侧链R基团），以及它们如何通过肽键连接形成多肽链。 蛋白质的一级结构（氨基酸序列）至关重要，它直接决定了蛋白质的三维折叠方式，进而决定了其功能。我们将详细阐述蛋白质的四级结构：一级结构（氨基酸序列）、二级结构（α-螺旋和β-折叠）、三级结构（多肽链的三维空间构象）和四级结构（多个多肽链组成的复合物）。蛋白质的折叠过程是一个复杂而精确的物理化学过程，许多蛋白质需要分子伴侣的帮助才能正确折叠。 然后，我们将重点介绍蛋白质的多样化功能。例如，酶是生物催化剂，能够极大地加速生化反应；结构蛋白（如胶原蛋白）提供细胞和组织的支撑；运输蛋白（如血红蛋白）负责物质的转运；信号蛋白（如激素）介导细胞间的通讯；免疫蛋白（抗体）抵御外来病原体。我们将通过具体实例，展现蛋白质在不同生命过程中扮演的关键角色。 第四章：细胞的微观世界——细胞器及其功能 细胞是生命的基本单位，而细胞器则是细胞内执行特定功能的微观“器官”。本章将带领读者进入细胞的微观世界，探索各种细胞器的形态、结构和功能。 我们将从真核细胞的核心——细胞核开始。细胞核是遗传物质DNA的所在地，也是基因转录的主要场所。我们将介绍核膜、核孔复合体以及染色质在细胞核内的分布。 接着，我们将探索细胞质中的各种细胞器。线粒体是细胞的“能量工厂”，负责细胞呼吸，产生ATP。内质网（粗面内质网和滑面内质网）参与蛋白质的合成、修饰和脂质的合成。高尔基体负责蛋白质和脂质的进一步加工、分类和包装，并形成囊泡运输到细胞内外。溶酶体含有水解酶，负责消化细胞内的废物和外来物质。过氧化物酶体参与脂质代谢和解毒。 此外，我们还将讨论细胞骨架。细胞骨架由微丝、微管和中间纤维组成，为细胞提供结构支撑，参与细胞运动、物质运输和细胞分裂。叶绿体（仅存在于植物和藻类细胞中）是光合作用的场所，将光能转化为化学能。液泡在植物细胞中扮演重要角色，储存水分、营养物质和废物。 我们将强调细胞器之间如何协同合作，共同维持细胞的生命活动，例如，DNA在细胞核中转录，mRNA通过核孔进入细胞质，在内质网上合成蛋白质，经高尔基体加工，最终可能被运送到细胞内外的不同位置发挥作用。 第五章：细胞信号的传递与调控 细胞并非孤立的实体，而是生活在一个动态变化的复杂环境中，需要不断地感知外界信号并做出响应。本章将揭示细胞信号传递的奥秘。 我们将首先介绍细胞信号传递的基本模式，包括旁分泌、自分泌、内分泌和直接接触信号。我们将重点关注信号分子（如激素、神经递质、生长因子）如何识别细胞表面的特定受体。 然后，我们将深入探讨受体介导的信号转导通路。细胞膜受体（如G蛋白偶联受体、酪氨酸激酶受体）和细胞内受体（如核受体）如何将外部信号转化为细胞内的生化信号。这一过程通常涉及一系列的分子事件，包括激酶的激活、磷酸化/去磷酸化、第二信使的产生（如cAMP、Ca2+）以及信号分子的放大。 最后，我们将强调信号转导通路的复杂性和精确性。一个信号分子可以激活多个下游通路，一个通路也可以接收来自不同信号分子的输入，从而实现复杂的细胞响应。这种精密的调控机制确保细胞能够对环境变化做出恰当的反应，维持稳态，并参与生命过程的发展和适应。我们将讨论信号失调可能导致的疾病，以及信号调控在生命活动中的重要性。 通过对DNA、基因、蛋白质、细胞器以及信号传递等基础概念的深入剖析，本书旨在为读者构建一个理解生命基本运作机制的全面框架。无论您是初次接触生命科学的学生，还是希望拓宽知识视野的专业人士，都将在这段探索细胞奥秘的旅程中受益匪浅，领略生命的神奇与精妙。

评分☆☆☆☆☆

翻开这本厚重的书册，我原本以为会沉浸在一片由DNA双螺旋、测序仪轰鸣声和复杂生物信息学算法构筑的知识海洋中，毕竟书名赫然印着“基因组学技术”。然而，书中的内容却像是一幅色彩斑斓但构图略显陈旧的田园风光画。它更侧重于描绘整个水产行业生态的宏观图景，详细描述了从鱼苗孵化到成鱼上市的各个环节中，可能遇到的环境压力因素和管理上的挑战。比如，关于水质调控的章节，写得非常详尽，涵盖了pH值、溶解氧、氨氮、亚硝酸盐的阈值范围及其对不同养殖物种的影响，甚至细致到不同季节的养殖密度调整建议。这些信息无疑对养殖一线的工作人员极具参考价值，但对于我这个主要关注如何利用基因数据来优化选育策略的研究人员来说，这些内容就像是背景音乐，虽然存在，却不是我想要听的主旋律。我试图在其中寻找关于转录组学数据分析流程的章节，或是关于如何设计高效的SNP芯片来加速性状改良的案例，但这些内容仿佛被刻意回避了，取而代之的是大量关于饲料营养配比的讨论，特别是蛋白质、脂肪酸的不同来源及其对肌肉品质的长期影响。这种内容上的“跑偏”，使得这本书的定位变得模糊不清，它更像是一本面向职业经理人的管理参考指南，而不是一本面向科研工作者的技术工具书。

评分☆☆☆☆☆

拿到这本《水产基因组学技术》后，我着实有些期待，希望能从中找到关于现代水产养殖领域基因编辑和分子标记的深入解析。然而，阅读过大半后，我发现这本书的侧重点似乎有些偏离我的预期。它似乎更偏向于对传统水产病害防治的系统性梳理，而非我所期望的前沿基因组学应用。书中花了大量的篇幅在介绍常见的细菌性、病毒性疾病的发病机制、临床症状以及传统的药物和免疫干预措施。虽然这些内容对于一个初入水产行业的人来说或许是宝贵的入门知识，但对于一个已经对分子生物学有所了解的读者而言，显得有些过于基础和详尽。特别是关于一些经典案例的复述，感觉像是将多年前的教科书内容做了重新整合，缺乏令人眼前一亮的创新视角或最新的技术突破的讨论。例如，在讨论到某个特定病原菌的防控时，更多的是引用了过去十年的研究数据，对于近两三年内基因测序技术带来的诊断方法的革新，几乎没有提及，这让作为读者的我感到信息有些滞后。我本来期待看到CRISPR/Cas9在抗病育种中的实际应用案例分析，或者至少是关于全基因组关联分析（GWAS）在筛选高抗性鱼类品种上的具体流程图解，但这些关键性的“技术”部分，在本书中几乎是只字未提，只停留在概念的简单介绍层面，远未达到“技术”二字所承诺的深度。整体而言，内容更像是一部详尽的水产病理学综述，而非一本聚焦于基因组学前沿技术的专业手册，这让我感到有些失落。

评分☆☆☆☆☆

这本书带给我的最强烈的感受，是它在方法论介绍上的“历史性”而非“前瞻性”。它似乎更像是一部回顾过去几十年水产生物学重大发现的编年史，而不是一部展望未来几十年水产基因组学应用前景的技术指南。我在寻找关于基因组组装（De novo assembly）流程的介绍，特别是对于非模式生物（如许多经济鱼类）的组装策略和Contig质量评估指标的讨论，这些是现代基因组学工作的基石。这本书中，相关章节仅用极小的篇幅提及了早期测序技术（如Sanger测序的贡献），对于目前主流的PacBio或Oxford Nanopore技术在长读长组装中的应用，几乎没有涉及。这让我感觉这本书的知识体系构建在了一个相对陈旧的技术框架之上。读者如果想了解如何利用最新的生物信息学工具来处理PB级的数据，或者如何利用转录组数据进行功能注释，这本书恐怕无法提供实质性的帮助。它更像是一本为已经掌握了基本分子生物学知识的读者，提供行业背景知识的辅助读物，而非一本能够直接提升基因组学技术操作和分析能力的实战手册，这与我对“水产基因组学技术”的期待产生了显著的偏差。

评分☆☆☆☆☆

说实话，这本书的排版和图表设计给我留下了非常深刻的印象，但这种印象并非全然是正面的。大量的流程图和表格占据了篇幅，它们通常用于解释一个较为复杂的生物学过程，比如某些鱼类对低温胁迫的生理反应机制。然而，这些流程图往往过于依赖文本注释而非清晰的符号逻辑，使得读者需要花费大量时间去解码图中的信息，而不是直观地理解概念。举个例子，有一张关于“免疫应答通路”的图示，它试图用非常复杂的树状结构来展示信号的传递，结果却因为字体过小和线条交叉重叠，使得核心的NF-κB通路的关键节点完全模糊不清，我不得不去查阅其他资料来辅助理解这张图的真正含义。此外，书中引用的文献资料大多集中在较早的期刊，特别是那些描述宏观生物学特性的经典研究，对于近年来利用高通量测序技术获得的突破性成果引用甚少。这让我不禁怀疑作者在整合最新研究进展方面的投入程度。如果一本技术书籍未能及时跟进领域内的主要方法论革新，那么其“技术”的含金量自然会大打折扣。我期待的是关于下一代测序数据分析管道的实战指导，哪怕是软件名称和参数设置的简要介绍，但书中对此的描述，寥寥无几，更像是蜻蜓点水般的提及，无法真正指导实践操作。

评分☆☆☆☆☆

在阅读过程中，我特别留意了书中对“技术标准化”和“数据共享”的态度。在现代生命科学研究中，技术的重复性和数据的可比性至关重要，特别是基因组学领域，不同的实验室采用不同的文库制备或比对算法，很容易导致结果的偏差。我本以为这本书会提供一套行业内推荐的、基于最新实践的SOP（标准操作规程）指南，至少在某些关键的分子提取或PCR扩增步骤上能给出明确的参数范围和注意事项。然而，书中对于技术细节的描述，显得相当的保守和笼统。例如，在谈及DNA提取时，它罗列了酸性、酚氯仿、商业试剂盒等几种方法，但对每种方法的优缺点、不同组织样本的最佳适用性，以及如何处理高黏度样本等“硬核”问题，仅用一两句话带过，这对于需要进行实际操作的初级技术人员来说，帮助非常有限。我甚至期待能看到一些关于FISH（荧光原位杂交）探针设计的基本原则，或者如何优化qPCR的引物效率的调试心得，但这些本应是“技术”书籍的核心内容，却被淡化处理了。整本书读下来，我感觉像是听了一场非常详尽的学术报告摘要，听到了“有什么”，但没有学到“怎么做”和“为什么这样做会更好”。