植物病害分子流行學導論(英文版)(附光盤)

植物病害分子流行學導論(英文版)(附光盤) pdf epub mobi txt 電子書 下載 2025

馬占鴻,馬忠華,駱勇 編
圖書標籤:
  • 植物病害學
  • 分子生物學
  • 流行病學
  • 植物病理學
  • 病害分子機製
  • 病害診斷
  • 病害防治
  • 農業科學
  • 生物技術
  • 光盤資源
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齣版社: 中國農業大學齣版社
ISBN:9787811171686
版次:1
商品編碼:10962638
包裝:平裝
開本:16開
齣版時間:2007-09-01
頁數:208
正文語種:中文
附件:光盤

具體描述

內容簡介

《植物病害分子流行學導論(英文版)》主要內容包括:Protein—based marker:Allozymes、DNA band—based markers、DNA sequence、References and suggested readings、CltAPTER 3 PCR—BASED TECHNIQUES、Classical PCR、Allele—specific PCR、Nested PCR、Multiplex PCR等等。

目錄

PART Ⅰ INTRoDUCTION
CHAPTER 1 INTRoDUCl’ION TO MoLECULAR EPIDEMIOLoGY
1—1 Basic concept of molecular epidemiology
1—2 Why molecular epidemiology
1—3 Comparisons between classical and molecular methods in epidemiology
1—4 Working approaches of molecular epidemiology
1—5 About the book
References and suggested readings

PART Ⅱ MoLECULAR TECHNIQUES USED IN EPIDEMIOLOGY
CHAPTER 2 MOLECULAR MARKERS
2—1 Protein—based marker:Allozymes
2—2 DNA band—based markers
2—3 DNA sequence
References and suggested readings

CltAPTER 3 PCR—BASED TECHNIQUES
3—1 Classical PCR
3—2 Allele—specific PCR
3—3 Nested PCR
3—4 Multiplex PCR
References and suggested readings

CHAPTER 4 QUANTITATIVE REAL‘TIME PCR
4—1 Introduction
4—2 Basic real—time PCR methods
4—3 Primer and probe design for real—time PCR
4—4 Result analysis
4—5 Applications of real—time PCR
References and suggested readings

CHAmR 5 PRIMER I)ESIGN
5—1 Some basic concepts for primer design
5—2 Computer programs used for primer design
5—3 An example of primer design using a computer program
5—4 Degenerated PCR primers

PART Ⅲ MoLECULAR EPIDEMIOLOGY oF PLANT DISEASES
CHAPTER 6 PATHoGEN IDENTIFICATIoN AND DISEASE DIAGNoSIS
6—1 Introduction
6—2 Use of species—specific genes or DNA regions for developing PCR primers
6—3 Use of anonymous unique DNA regions for developing PCR primers
6—4 PCR inhibitors
Summary
References and suggested readings

CHAPTER 7 FUNGAL PATHoGEN REPRoDUCTIVE MoDES
7—1 Frequencies of genotypes
7—2 Deviation from Hardy—Weinberg expectations
7—3 Parsimony Tree Length Permutation(PTLPT)
7—4 Index of association(IA)
References and suggested readings

CHAPTER 8 DETEMINATIoN AND QUANTIFICATION OF INITIAL INOCULUM OF EPIDEMICS
8—1 Introduction
8—2 Molecular methods for quantification of initial inoculum
8—3 Examples of quantification of initial inoculum using molecular methods
Remarkable conclusion
References and suggested readings

CHPTER 9 TEMpORAL AND SPATIAL DEVELOPMENT oF PATHoGEN POPULATIoNS
9—1 Introduction
9—2 Molecular approaches
9—3 Monitoring pathogen population structures
9—4 Studying spatial—temporal dynamics of pathogen populations
9—5 Providing information needed for disease management
Summary
References and suggested readings

CHAPTER 10 PATHoGEN LONG—DISTANCE DIsPERSAL AND MIGRATION
10—1 Introduction
10—2 Pathogen lon9—distance dispersal and disease epidemics
10—3 Traditional methods to determine or infer pathogen lon9—distance dispersal
10—4 Molecular methods to study pathogen lon9—distance dispersal
10—5 Examples
Summary
……
PART IV METHODOLOGY OF DATA ANLYSIS
INDEX

前言/序言


《植物病害分子流行學導論:探索病原體與宿主的隱秘對話》 第一章:分子流行學的基石——病害發生的分子邏輯 植物病害的發生並非偶然,其背後隱藏著一套精密的分子交互邏輯。本章將帶您深入植物病害分子流行學的核心,揭示病原體如何入侵、定殖並引發係統性損傷,而植物又如何啓動防禦機製與之抗衡。我們將從最基本的分子層麵齣發,剖析病原體基因組的奧秘,理解緻病基因(virulence genes)在病害發生過程中的關鍵作用,包括它們如何編碼效應蛋白(effector proteins)來操縱宿主細胞功能,逃避或抑製宿主免疫。 同時,我們將聚焦植物免疫係統的分子機製。您將瞭解到植物如何通過模式識彆受體(pattern recognition receptors, PRRs)識彆病原相關分子模式(pathogen-associated molecular patterns, PAMPs),啓動PAMPs觸發的免疫(PAMP-triggered immunity, PTI)。更進一步,我們將探討效應器觸發的免疫(effector-triggered immunity, ETI),這是植物針對特定效應蛋白的第二次、更強大的防禦反應。在這個相互作用的網絡中,關鍵的信號轉導通路,如MAPK級聯反應和激素信號(如水楊酸、茉莉酸、脫落酸)的調控,將得到詳細闡述,解釋它們如何整閤外部信號並驅動下遊的防禦基因錶達。 此外,本章還將介紹一些重要的分子工具和技術,它們為研究植物-病原體互作提供瞭強大的支持。例如,基因組學和轉錄組學技術如何幫助我們識彆病原體的緻病基因和宿主的免疫基因;蛋白質組學和代謝組學如何揭示互作過程中發生的蛋白質和代謝物變化;以及CRISPR-Cas9等基因編輯技術如何用於功能驗證。通過對這些分子機製和研究方法的理解,讀者將為後續更深入的學習奠定堅實的基礎,認識到植物病害的發生是一個動態的、多層次的分子對話過程。 第二章:病原體多樣性與分子進化——緻病力的演變之路 植物病原體種類繁多,從真菌、細菌、病毒到綫蟲,它們各自擁有獨特的侵染策略和分子武器。本章旨在探索植物病原體多樣性的分子根源,以及它們如何通過分子進化獲得和增強緻病力。我們將首先概述主要植物病原體類群的分類學特徵及其在生態係統中的地位,然後深入探討不同病原體在基因組結構、復製策略和緻病因子方麵的差異。 對於真菌病原體,我們將關注細胞壁降解酶、毒素、酶促活性蛋白等緻病因子的分子機製,以及它們如何影響植物組織的破環和營養的吸收。細菌病原體方麵,我們將詳細解析分泌係統(如III型分泌係統)在遞送效應蛋白至宿主細胞中的作用,以及産生細胞毒素、植物生長調節劑等對宿主的影響。病毒病原體的復製機製,包括其RNA或DNA基因組的復製策略,以及如何利用宿主細胞的分子機器完成生命周期,也將成為本章的重點。 分子進化是理解病原體緻病力不斷演變的關鍵。本章將介紹驅動病原體進化的主要進化力量,如自然選擇、基因突變、基因重組和基因水平轉移。我們將探討基因水平轉移如何使病原體快速獲得新的緻病基因或抗性基因,從而適應新的宿主或逃避宿主的防禦。同時,我們將分析與緻病力相關的基因(virulence factor genes)的分子進化模式,例如它們是如何通過重復、丟失或適應性演化來維持或增強緻病性的。 此外,本章還將介紹一些用於研究病原體分子進化的計算生物學方法,例如係統發育分析、基因組比較和進化軌跡重建。這些工具能夠幫助我們追溯病原體的起源、傳播曆史以及緻病力的演化路徑。通過理解病原體的多樣性和分子進化,我們能更好地預測新發病害的齣現,並為開發更有效的病害管理策略提供分子層麵的洞察。 第三章:植物抗性的分子機製——守衛生命綫的多重防綫 植物並非被動的受害者,它們擁有一係列復雜的分子機製來抵抗病原體的侵染。本章將聚焦植物抗性的分子基礎,深入解析植物如何構建和激活多重防綫,以保護自身免受病害的侵害。我們將從基因組層麵開始,瞭解控製著植物抗性的基因,包括抗性基因(R genes)的結構、功能和多樣性。 R基因通常編碼核苷酸結閤-富含亮氨酸重復序列(NB-LRR)蛋白,它們能夠直接或間接識彆病原體的效應蛋白,從而啓動高度特異性的抗性反應。我們將詳細闡述R基因介導的ETI信號轉導通路,包括其激活下遊的基因沉默、細胞凋亡以及防禦信號的産生。 除瞭R基因介導的特異性抗性,植物還擁有非特異性的先天免疫係統。本章將深入探討PTI機製,包括PRRs識彆PAMPs後觸發的下遊信號傳導,例如活性氧(ROS)的爆發、細胞壁的加厚、以及防禦相關基因(defense-related genes, DRGs)的錶達上調。ROS不僅是防禦信號,還能直接損傷病原體。 植物的抗性還受到激素信號的精妙調控。我們將詳細分析水楊酸(SA)、茉莉酸(JA)和乙烯(ET)等植物激素在植物抗性中的關鍵作用。SA通常與抵抗生物型病原體(biotrophic pathogens)相關,而JA和ET則在抵抗非生物型病原體(necrotrophic pathogens)和損傷中發揮重要作用。這些激素之間復雜的相互作用和信號網絡的整閤,共同決定瞭植物對不同病原體的抗性反應。 此外,本章還將探討一些非基因編碼的抗性機製,例如抗性相關蛋白(pathogenesis-related proteins, PR proteins)的産生,它們具有抗菌、抗病毒或誘導抗性的活性。我們還將介紹植物如何利用錶觀遺傳修飾來調控基因錶達,從而影響抗性的發生和持續。通過對這些復雜的分子機製的深入理解,我們可以更好地挖掘和利用植物的內源抗性潛力,為開發持久的抗病品種提供理論基礎。 第四章:病害的傳播與檢測——分子標記的時代 病害的有效管理離不開對病原體傳播途徑的理解和及時準確的檢測。本章將深入探討病害傳播的分子基礎,以及現代分子技術在病害檢測與診斷中的革命性應用。我們將首先分析不同傳播媒介(如空氣、土壤、種子、昆蟲)如何影響病原體的傳播動態,以及病原體自身如何利用分子機製適應和利用這些傳播途徑。 例如,真菌孢子錶麵的分子結構如何影響其在空氣中的傳播和附著;細菌如何通過形成生物膜(biofilm)來在土壤和植物組織中定殖和傳播;病毒如何依賴昆蟲等媒介傳播,以及它們如何利用宿主蛋白來促進傳播。 本章的重點將放在分子檢測技術上。您將瞭解到聚閤酶鏈式反應(PCR)及其各種變體(如實時熒光定量PCR, RT-qPCR)是如何被廣泛應用於檢測特定病原體DNA或RNA的存在,具有高靈敏度和特異性。我們將深入解析這些技術的基本原理、操作流程以及在病害早期診斷中的優勢。 此外,我們將介紹基於DNA測序的分子診斷方法,例如高通量測序(high-throughput sequencing, HTS),它能夠一次性檢測多種病原體,甚至發現未知病原體。DNA條形碼技術、核酸探針雜交技術也將得到介紹,它們在病原體鑒定和種群分析中發揮著重要作用。 除瞭DNA/RNA的檢測,蛋白質水平的檢測方法,如酶聯免疫吸附試驗(ELISA)和質譜技術,也將在本章中得到介紹,它們能夠快速、準確地檢測病原體産生的特異性蛋白。 通過對病害傳播分子機製和先進分子檢測技術的掌握,讀者將能夠理解如何利用分子信息來追蹤病害的源頭,評估傳播風險,並製定精準有效的防控策略。這不僅有助於減少病害造成的經濟損失,更能為保障糧食安全和維護生態健康做齣貢獻。 第五章:分子流行學與可持續農業——麵嚮未來的挑戰與機遇 植物病害分子流行學不僅是基礎科學的研究領域,更是應對全球農業可持續發展挑戰的關鍵。本章將展望分子流行學的未來發展方嚮,探討其在現代農業中的實際應用,以及在應對氣候變化、病原體抗藥性等全球性挑戰中所扮演的重要角色。 我們將首先討論分子流行學如何驅動下一代抗病育種。通過利用基因組編輯技術(如CRISPR-Cas9)和分子標記輔助選擇(MAS),我們可以更高效、精確地將抗性基因導入作物品種,培育齣具有優異抗病性的新品種。我們將深入探討基因編輯技術在改良植物抗性方麵的潛力和局限性,以及如何利用自然存在的抗性基因庫。 其次,本章將關注分子流行學在病害監測與預警係統中的應用。通過建立基於分子標記的病害數據庫,結閤環境監測和大數據分析,我們可以構建智能化的病害預警係統,提前預測病害的發生和流行趨勢,從而實現前瞻性的防控。我們將討論如何利用環境DNA(eDNA)技術來監測環境中病原體的存在,實現無損、高效的早期預警。 氣候變化對植物病害的流行具有深遠影響,本章將探討分子流行學如何幫助我們理解和應對這些變化。例如,研究病原體如何適應升溫、乾旱或洪澇等環境脅迫,以及植物抗性基因在不同環境條件下的錶達變化,有助於我們預測未來病害的潛在威脅。 此外,我們還將討論病原體對農用化學品産生抗性的分子機製,以及分子流行學如何為開發新的、更有效的病害防治策略提供綫索,例如靶嚮緻病基因的RNAi技術,或利用生物防治微生物的分子互作。 最後,本章將強調分子流行學跨學科閤作的重要性。研究人員需要與育種傢、農學傢、生態學傢、計算機科學傢等緊密閤作,將分子層麵的研究成果轉化為實際的農業生産應用。通過整閤分子科學、遺傳學、生態學和信息科學等多方麵的知識,分子流行學將為實現全球農業的可持續發展貢獻重要力量,保障人類的糧食安全和生態健康。

用戶評價

評分

這本書的標題提示瞭一個深度融閤的學科方嚮,我關注的是它是否能清晰地闡述“分子”如何影響“流行學”的宏觀格局。很多病理學研究側重於細胞或個體病害的機製,而流行學研究則側重於群體感染的數學模型。如何用分子證據來校準或驅動這些模型,是這本書的核心挑戰。我期待看到章節會介紹一些具體的分子流行學模型,例如基於有效重組率或突變率的擴散模型。如果能提供對不同植物病害係統(如真菌、細菌和病毒)的比較分析,並指齣每類病原體在分子流行學研究上的獨特難點和突破口,這本書的結構會更具深度。例如,病毒的快速演化速率和真菌的無性/有性繁殖模式對流行病學分析意味著截然不同的分子策略。我希望這本書不僅是知識的傳授,更是一種批判性思維的訓練,引導讀者思考:當前我們掌握的分子數據,在多大程度上能夠真正指導我們製定齣更具韌性和針對性的病害管理策略。

評分

作為一名習慣瞭閱讀英文專業文獻的研究人員,我非常看重其英文原版的嚴謹性和國際視野。通常,英文原版在術語的規範性、引用的前沿性上更有保證。對於“分子流行學”這個專業性極強的領域,細節的精確性是成敗的關鍵。我希望這本書在探討病原體變異性時,能夠細緻區分不同地理區域間的遺傳差異,並解釋這些差異如何影響病原體的生物學特性,例如毒力或對殺菌劑的敏感性。光盤部分的使用體驗也至關重要,如果它包含的是高分辨率的分子圖譜、交互式數據可視化工具,或者是一些經典實驗的視頻演示,那麼它將極大地提升學習效率。如果光盤隻是簡單地附帶瞭PDF文件,那就顯得有些敷衍瞭。一本好的導論,應該能將復雜的分子數據“可視化”,讓讀者能直觀地感受到分子變異是如何驅動群體水平的流行動態變化的。

評分

我對這本書最感興趣的點在於其對“時間與空間”的整閤處理能力。植物病害的流行本質上是一個時空動態過程,而分子信息正是解析這個動態過程的關鍵。我期待書中能有專門的章節討論如何利用分子鍾(Molecular Clock)技術來估算病原體的演化速率和起源時間,這對於理解重大疫情的爆發節點至關重要。同時,地理信息係統(GIS)與分子數據的結閤也是分子流行學的重要分支,我希望看到如何利用這些分子標記來精確定位病害的引入路徑和擴散熱點。如果作者能結閤全球範圍內的案例研究,展示分子流行學如何成功地乾預瞭如小麥銹病、柑橘潰瘍病等重大全球性病害的防控,那麼這本書的價值將不可估量。這種結閤瞭生命科學、數學建模和地理科學的跨學科視角,正是我在尋找的。這本書如果能做到這一點,那它就超越瞭一般的專業教材,而成為一個研究範式的展示窗口。

評分

這本《植物病害分子流行學導論》看起來像是為那些想深入瞭解病原體如何傳播和演變,並希望在分子層麵上對其進行控製的科研人員或高級學生量身定製的。從書名來看,它很可能涵蓋瞭現代植物病理學中幾個非常前沿和關鍵的領域。我猜想,它會詳細闡述從基因組學到蛋白組學的各種工具如何被用來追蹤病原菌、病毒或綫蟲的移動和變異。這本書應該不會停留在傳統的宏觀描述層麵,而是會深入到病原體入侵宿主細胞的分子機製,以及宿主如何激活或逃避免疫反應的細節。特彆是“分子流行學”這個概念,暗示瞭書中會對如何利用分子標記(比如SNP、微衛星)來構建病原體的種群遺傳學圖譜有深入的探討。我個人很期待看到它如何結閤流行病學模型和分子數據,來預測和管理新齣現的或耐藥的植物病害。如果光盤內容豐富,我希望它能提供一些實際操作的案例分析,比如如何處理原始測序數據,或者如何運行一些經典的流行病學模擬軟件。總的來說,這本書的深度和專業性,應該能滿足那些想從基礎研究走嚮實際病害管理策略的專業人士的需求,它應該是一本嚴謹的工具書,而不是通識讀物。

評分

拿到這本“分子流行學導論”時,我首先關注的是它是否能搭建起從實驗室的試管到田間的實際應用之間的橋梁。現在很多教材往往偏嚮理論推導,讓人感覺知識很“懸空”。我希望這本書能提供清晰的框架,解釋在分子層麵發現的機製——比如某個效應蛋白的功能,是如何轉化為田間病害爆發的驅動力。閱讀體驗上,我傾嚮於那些邏輯清晰、圖錶豐富的書籍。如果它能用清晰的流程圖展示分子流行病學的研究路綫圖,從樣本采集、DNA提取、測序到數據分析,再到最終的風險評估,那將是極大的加分項。此外,對於“導論”這個定位,我希望它對初學者是友好的,至少在前幾章能有效鋪墊基礎知識,比如常用的分子生物學技術在流行病學研究中的應用。如果它能涵蓋一些新興技術,比如基於人工智能的病害預測模型,那就更具前瞻性瞭。總而言之,我期望它不僅是知識的堆砌,更是一套解決實際問題的思維導引。

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