植物病害分子流行学导论（英文版）（附光盘） pdf epub mobi txt 电子书 下载 2025

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马占鸿，马忠华，骆勇 编

图书标签:

• 植物病害学
• 分子生物学
• 流行病学
• 植物病理学
• 病害分子机制
• 病害诊断
• 病害防治
• 农业科学
• 生物技术
• 光盘资源

出版社： 中国农业大学出版社

ISBN：9787811171686

版次：1

商品编码：10962638

包装：平装

开本：16开

出版时间：2007-09-01

页数：208

正文语种：中文

附件：光盘

内容简介

《植物病害分子流行学导论（英文版）》主要内容包括：Protein—based marker：Allozymes、DNA band—based markers、DNA sequence、References and suggested readings、CltAPTER 3 PCR—BASED TECHNIQUES、Classical PCR、Allele—specific PCR、Nested PCR、Multiplex PCR等等。

目录

PART Ⅰ INTRoDUCTION
CHAPTER 1 INTRoDUCl’ION TO MoLECULAR EPIDEMIOLoGY
1—1 Basic concept of molecular epidemiology
1—2 Why molecular epidemiology
1—3 Comparisons between classical and molecular methods in epidemiology
1—4 Working approaches of molecular epidemiology
1—5 About the book
References and suggested readings

PART Ⅱ MoLECULAR TECHNIQUES USED IN EPIDEMIOLOGY
CHAPTER 2 MOLECULAR MARKERS
2—1 Protein—based marker：Allozymes
2—2 DNA band—based markers
2—3 DNA sequence
References and suggested readings

CltAPTER 3 PCR—BASED TECHNIQUES
3—1 Classical PCR
3—2 Allele—specific PCR
3—3 Nested PCR
3—4 Multiplex PCR
References and suggested readings

CHAPTER 4 QUANTITATIVE REAL‘TIME PCR
4—1 Introduction
4—2 Basic real—time PCR methods
4—3 Primer and probe design for real—time PCR
4—4 Result analysis
4—5 Applications of real—time PCR
References and suggested readings

CHAmR 5 PRIMER I）ESIGN
5—1 Some basic concepts for primer design
5—2 Computer programs used for primer design
5—3 An example of primer design using a computer program
5—4 Degenerated PCR primers

PART Ⅲ MoLECULAR EPIDEMIOLOGY oF PLANT DISEASES
CHAPTER 6 PATHoGEN IDENTIFICATIoN AND DISEASE DIAGNoSIS
6—1 Introduction
6—2 Use of species—specific genes or DNA regions for developing PCR primers
6—3 Use of anonymous unique DNA regions for developing PCR primers
6—4 PCR inhibitors
Summary
References and suggested readings

CHAPTER 7 FUNGAL PATHoGEN REPRoDUCTIVE MoDES
7—1 Frequencies of genotypes
7—2 Deviation from Hardy—Weinberg expectations
7—3 Parsimony Tree Length Permutation（PTLPT）
7—4 Index of association（IA）
References and suggested readings

CHAPTER 8 DETEMINATIoN AND QUANTIFICATION OF INITIAL INOCULUM OF EPIDEMICS
8—1 Introduction
8—2 Molecular methods for quantification of initial inoculum
8—3 Examples of quantification of initial inoculum using molecular methods
Remarkable conclusion
References and suggested readings

CHPTER 9 TEMpORAL AND SPATIAL DEVELOPMENT oF PATHoGEN POPULATIoNS
9—1 Introduction
9—2 Molecular approaches
9—3 Monitoring pathogen population structures
9—4 Studying spatial—temporal dynamics of pathogen populations
9—5 Providing information needed for disease management
Summary
References and suggested readings

CHAPTER 10 PATHoGEN LONG—DISTANCE DIsPERSAL AND MIGRATION
10—1 Introduction
10—2 Pathogen lon9—distance dispersal and disease epidemics
10—3 Traditional methods to determine or infer pathogen lon9—distance dispersal
10—4 Molecular methods to study pathogen lon9—distance dispersal
10—5 Examples
Summary
……
PART IV METHODOLOGY OF DATA ANLYSIS
INDEX

前言/序言

《植物病害分子流行学导论：探索病原体与宿主的隐秘对话》 第一章：分子流行学的基石——病害发生的分子逻辑 植物病害的发生并非偶然，其背后隐藏着一套精密的分子交互逻辑。本章将带您深入植物病害分子流行学的核心，揭示病原体如何入侵、定殖并引发系统性损伤，而植物又如何启动防御机制与之抗衡。我们将从最基本的分子层面出发，剖析病原体基因组的奥秘，理解致病基因（virulence genes）在病害发生过程中的关键作用，包括它们如何编码效应蛋白（effector proteins）来操纵宿主细胞功能，逃避或抑制宿主免疫。 同时，我们将聚焦植物免疫系统的分子机制。您将了解到植物如何通过模式识别受体（pattern recognition receptors, PRRs）识别病原相关分子模式（pathogen-associated molecular patterns, PAMPs），启动PAMPs触发的免疫（PAMP-triggered immunity, PTI）。更进一步，我们将探讨效应器触发的免疫（effector-triggered immunity, ETI），这是植物针对特定效应蛋白的第二次、更强大的防御反应。在这个相互作用的网络中，关键的信号转导通路，如MAPK级联反应和激素信号（如水杨酸、茉莉酸、脱落酸）的调控，将得到详细阐述，解释它们如何整合外部信号并驱动下游的防御基因表达。 此外，本章还将介绍一些重要的分子工具和技术，它们为研究植物-病原体互作提供了强大的支持。例如，基因组学和转录组学技术如何帮助我们识别病原体的致病基因和宿主的免疫基因；蛋白质组学和代谢组学如何揭示互作过程中发生的蛋白质和代谢物变化；以及CRISPR-Cas9等基因编辑技术如何用于功能验证。通过对这些分子机制和研究方法的理解，读者将为后续更深入的学习奠定坚实的基础，认识到植物病害的发生是一个动态的、多层次的分子对话过程。 第二章：病原体多样性与分子进化——致病力的演变之路 植物病原体种类繁多，从真菌、细菌、病毒到线虫，它们各自拥有独特的侵染策略和分子武器。本章旨在探索植物病原体多样性的分子根源，以及它们如何通过分子进化获得和增强致病力。我们将首先概述主要植物病原体类群的分类学特征及其在生态系统中的地位，然后深入探讨不同病原体在基因组结构、复制策略和致病因子方面的差异。 对于真菌病原体，我们将关注细胞壁降解酶、毒素、酶促活性蛋白等致病因子的分子机制，以及它们如何影响植物组织的破环和营养的吸收。细菌病原体方面，我们将详细解析分泌系统（如III型分泌系统）在递送效应蛋白至宿主细胞中的作用，以及产生细胞毒素、植物生长调节剂等对宿主的影响。病毒病原体的复制机制，包括其RNA或DNA基因组的复制策略，以及如何利用宿主细胞的分子机器完成生命周期，也将成为本章的重点。 分子进化是理解病原体致病力不断演变的关键。本章将介绍驱动病原体进化的主要进化力量，如自然选择、基因突变、基因重组和基因水平转移。我们将探讨基因水平转移如何使病原体快速获得新的致病基因或抗性基因，从而适应新的宿主或逃避宿主的防御。同时，我们将分析与致病力相关的基因（virulence factor genes）的分子进化模式，例如它们是如何通过重复、丢失或适应性演化来维持或增强致病性的。 此外，本章还将介绍一些用于研究病原体分子进化的计算生物学方法，例如系统发育分析、基因组比较和进化轨迹重建。这些工具能够帮助我们追溯病原体的起源、传播历史以及致病力的演化路径。通过理解病原体的多样性和分子进化，我们能更好地预测新发病害的出现，并为开发更有效的病害管理策略提供分子层面的洞察。 第三章：植物抗性的分子机制——守卫生命线的多重防线 植物并非被动的受害者，它们拥有一系列复杂的分子机制来抵抗病原体的侵染。本章将聚焦植物抗性的分子基础，深入解析植物如何构建和激活多重防线，以保护自身免受病害的侵害。我们将从基因组层面开始，了解控制着植物抗性的基因，包括抗性基因（R genes）的结构、功能和多样性。 R基因通常编码核苷酸结合-富含亮氨酸重复序列（NB-LRR）蛋白，它们能够直接或间接识别病原体的效应蛋白，从而启动高度特异性的抗性反应。我们将详细阐述R基因介导的ETI信号转导通路，包括其激活下游的基因沉默、细胞凋亡以及防御信号的产生。 除了R基因介导的特异性抗性，植物还拥有非特异性的先天免疫系统。本章将深入探讨PTI机制，包括PRRs识别PAMPs后触发的下游信号传导，例如活性氧（ROS）的爆发、细胞壁的加厚、以及防御相关基因（defense-related genes, DRGs）的表达上调。ROS不仅是防御信号，还能直接损伤病原体。 植物的抗性还受到激素信号的精妙调控。我们将详细分析水杨酸（SA）、茉莉酸（JA）和乙烯（ET）等植物激素在植物抗性中的关键作用。SA通常与抵抗生物型病原体（biotrophic pathogens）相关，而JA和ET则在抵抗非生物型病原体（necrotrophic pathogens）和损伤中发挥重要作用。这些激素之间复杂的相互作用和信号网络的整合，共同决定了植物对不同病原体的抗性反应。 此外，本章还将探讨一些非基因编码的抗性机制，例如抗性相关蛋白（pathogenesis-related proteins, PR proteins）的产生，它们具有抗菌、抗病毒或诱导抗性的活性。我们还将介绍植物如何利用表观遗传修饰来调控基因表达，从而影响抗性的发生和持续。通过对这些复杂的分子机制的深入理解，我们可以更好地挖掘和利用植物的内源抗性潜力，为开发持久的抗病品种提供理论基础。 第四章：病害的传播与检测——分子标记的时代 病害的有效管理离不开对病原体传播途径的理解和及时准确的检测。本章将深入探讨病害传播的分子基础，以及现代分子技术在病害检测与诊断中的革命性应用。我们将首先分析不同传播媒介（如空气、土壤、种子、昆虫）如何影响病原体的传播动态，以及病原体自身如何利用分子机制适应和利用这些传播途径。 例如，真菌孢子表面的分子结构如何影响其在空气中的传播和附着；细菌如何通过形成生物膜（biofilm）来在土壤和植物组织中定殖和传播；病毒如何依赖昆虫等媒介传播，以及它们如何利用宿主蛋白来促进传播。 本章的重点将放在分子检测技术上。您将了解到聚合酶链式反应（PCR）及其各种变体（如实时荧光定量PCR, RT-qPCR）是如何被广泛应用于检测特定病原体DNA或RNA的存在，具有高灵敏度和特异性。我们将深入解析这些技术的基本原理、操作流程以及在病害早期诊断中的优势。 此外，我们将介绍基于DNA测序的分子诊断方法，例如高通量测序（high-throughput sequencing, HTS），它能够一次性检测多种病原体，甚至发现未知病原体。DNA条形码技术、核酸探针杂交技术也将得到介绍，它们在病原体鉴定和种群分析中发挥着重要作用。 除了DNA/RNA的检测，蛋白质水平的检测方法，如酶联免疫吸附试验（ELISA）和质谱技术，也将在本章中得到介绍，它们能够快速、准确地检测病原体产生的特异性蛋白。 通过对病害传播分子机制和先进分子检测技术的掌握，读者将能够理解如何利用分子信息来追踪病害的源头，评估传播风险，并制定精准有效的防控策略。这不仅有助于减少病害造成的经济损失，更能为保障粮食安全和维护生态健康做出贡献。 第五章：分子流行学与可持续农业——面向未来的挑战与机遇 植物病害分子流行学不仅是基础科学的研究领域，更是应对全球农业可持续发展挑战的关键。本章将展望分子流行学的未来发展方向，探讨其在现代农业中的实际应用，以及在应对气候变化、病原体抗药性等全球性挑战中所扮演的重要角色。 我们将首先讨论分子流行学如何驱动下一代抗病育种。通过利用基因组编辑技术（如CRISPR-Cas9）和分子标记辅助选择（MAS），我们可以更高效、精确地将抗性基因导入作物品种，培育出具有优异抗病性的新品种。我们将深入探讨基因编辑技术在改良植物抗性方面的潜力和局限性，以及如何利用自然存在的抗性基因库。 其次，本章将关注分子流行学在病害监测与预警系统中的应用。通过建立基于分子标记的病害数据库，结合环境监测和大数据分析，我们可以构建智能化的病害预警系统，提前预测病害的发生和流行趋势，从而实现前瞻性的防控。我们将讨论如何利用环境DNA（eDNA）技术来监测环境中病原体的存在，实现无损、高效的早期预警。 气候变化对植物病害的流行具有深远影响，本章将探讨分子流行学如何帮助我们理解和应对这些变化。例如，研究病原体如何适应升温、干旱或洪涝等环境胁迫，以及植物抗性基因在不同环境条件下的表达变化，有助于我们预测未来病害的潜在威胁。 此外，我们还将讨论病原体对农用化学品产生抗性的分子机制，以及分子流行学如何为开发新的、更有效的病害防治策略提供线索，例如靶向致病基因的RNAi技术，或利用生物防治微生物的分子互作。 最后，本章将强调分子流行学跨学科合作的重要性。研究人员需要与育种家、农学家、生态学家、计算机科学家等紧密合作，将分子层面的研究成果转化为实际的农业生产应用。通过整合分子科学、遗传学、生态学和信息科学等多方面的知识，分子流行学将为实现全球农业的可持续发展贡献重要力量，保障人类的粮食安全和生态健康。

评分☆☆☆☆☆

拿到这本“分子流行学导论”时，我首先关注的是它是否能搭建起从实验室的试管到田间的实际应用之间的桥梁。现在很多教材往往偏向理论推导，让人感觉知识很“悬空”。我希望这本书能提供清晰的框架，解释在分子层面发现的机制——比如某个效应蛋白的功能，是如何转化为田间病害爆发的驱动力。阅读体验上，我倾向于那些逻辑清晰、图表丰富的书籍。如果它能用清晰的流程图展示分子流行病学的研究路线图，从样本采集、DNA提取、测序到数据分析，再到最终的风险评估，那将是极大的加分项。此外，对于“导论”这个定位，我希望它对初学者是友好的，至少在前几章能有效铺垫基础知识，比如常用的分子生物学技术在流行病学研究中的应用。如果它能涵盖一些新兴技术，比如基于人工智能的病害预测模型，那就更具前瞻性了。总而言之，我期望它不仅是知识的堆砌，更是一套解决实际问题的思维导引。

评分☆☆☆☆☆

这本《植物病害分子流行学导论》看起来像是为那些想深入了解病原体如何传播和演变，并希望在分子层面上对其进行控制的科研人员或高级学生量身定制的。从书名来看，它很可能涵盖了现代植物病理学中几个非常前沿和关键的领域。我猜想，它会详细阐述从基因组学到蛋白组学的各种工具如何被用来追踪病原菌、病毒或线虫的移动和变异。这本书应该不会停留在传统的宏观描述层面，而是会深入到病原体入侵宿主细胞的分子机制，以及宿主如何激活或逃避免疫反应的细节。特别是“分子流行学”这个概念，暗示了书中会对如何利用分子标记（比如SNP、微卫星）来构建病原体的种群遗传学图谱有深入的探讨。我个人很期待看到它如何结合流行病学模型和分子数据，来预测和管理新出现的或耐药的植物病害。如果光盘内容丰富，我希望它能提供一些实际操作的案例分析，比如如何处理原始测序数据，或者如何运行一些经典的流行病学模拟软件。总的来说，这本书的深度和专业性，应该能满足那些想从基础研究走向实际病害管理策略的专业人士的需求，它应该是一本严谨的工具书，而不是通识读物。

评分☆☆☆☆☆

我对这本书最感兴趣的点在于其对“时间与空间”的整合处理能力。植物病害的流行本质上是一个时空动态过程，而分子信息正是解析这个动态过程的关键。我期待书中能有专门的章节讨论如何利用分子钟（Molecular Clock）技术来估算病原体的演化速率和起源时间，这对于理解重大疫情的爆发节点至关重要。同时，地理信息系统（GIS）与分子数据的结合也是分子流行学的重要分支，我希望看到如何利用这些分子标记来精确定位病害的引入路径和扩散热点。如果作者能结合全球范围内的案例研究，展示分子流行学如何成功地干预了如小麦锈病、柑橘溃疡病等重大全球性病害的防控，那么这本书的价值将不可估量。这种结合了生命科学、数学建模和地理科学的跨学科视角，正是我在寻找的。这本书如果能做到这一点，那它就超越了一般的专业教材，而成为一个研究范式的展示窗口。

评分☆☆☆☆☆

作为一名习惯了阅读英文专业文献的研究人员，我非常看重其英文原版的严谨性和国际视野。通常，英文原版在术语的规范性、引用的前沿性上更有保证。对于“分子流行学”这个专业性极强的领域，细节的精确性是成败的关键。我希望这本书在探讨病原体变异性时，能够细致区分不同地理区域间的遗传差异，并解释这些差异如何影响病原体的生物学特性，例如毒力或对杀菌剂的敏感性。光盘部分的使用体验也至关重要，如果它包含的是高分辨率的分子图谱、交互式数据可视化工具，或者是一些经典实验的视频演示，那么它将极大地提升学习效率。如果光盘只是简单地附带了PDF文件，那就显得有些敷衍了。一本好的导论，应该能将复杂的分子数据“可视化”，让读者能直观地感受到分子变异是如何驱动群体水平的流行动态变化的。

评分☆☆☆☆☆

这本书的标题提示了一个深度融合的学科方向，我关注的是它是否能清晰地阐述“分子”如何影响“流行学”的宏观格局。很多病理学研究侧重于细胞或个体病害的机制，而流行学研究则侧重于群体感染的数学模型。如何用分子证据来校准或驱动这些模型，是这本书的核心挑战。我期待看到章节会介绍一些具体的分子流行学模型，例如基于有效重组率或突变率的扩散模型。如果能提供对不同植物病害系统（如真菌、细菌和病毒）的比较分析，并指出每类病原体在分子流行学研究上的独特难点和突破口，这本书的结构会更具深度。例如，病毒的快速演化速率和真菌的无性/有性繁殖模式对流行病学分析意味着截然不同的分子策略。我希望这本书不仅是知识的传授，更是一种批判性思维的训练，引导读者思考：当前我们掌握的分子数据，在多大程度上能够真正指导我们制定出更具韧性和针对性的病害管理策略。