新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础

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[美] S.M.伊克巴尔,R.巴希尔 著,刘全俊,陆祖宏,谢骁 译
图书标签:
  • 纳米孔
  • 生物传感器
  • 生物物理学
  • 分子生物学
  • 生物化学
  • 纳米技术
  • 单分子检测
  • 生物分子相互作用
  • 新生物学
  • 传感技术
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出版社: 科学出版社
ISBN:9787030367037
版次:01
商品编码:11213642
包装:平装
丛书名: 新生物学丛书
开本:16开
出版时间:2013-03-01
用纸:胶版纸
页数:340
正文语种:中文

具体描述

内容简介

  纳米孔检测技术的理论提出于20世纪末,被认为是能够首先解决单分子、非标记检测的重要技术之一。《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》围绕纳米孔技术这个主题,介绍了纳米孔结合生物标记检测技术,以及其用作基因组测序和疾病早期检测的最新研究进展。全书共分14章,分别邀请了国际上纳米孔研究领域起步最早、成果丰硕的研究小组的领军学者,从纳米孔技术研究的各个角度,如理论计算、实验体系、数据模拟和分析以及应用性检测等方面的发展历史、当前近况以及发展趋势等进行了介绍和总结。
  《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》会为纳米孔领域的科研工作者和研究生提供极大的帮助和重要的参考价值。

目录

《新生物学丛书》丛书序

本书序

译者序

前言

作者列表

第1章 用于核酸序列分析的固态纳米孔传感器

第2章 光镊集成德尔固态纳米孔在分子检测盒力谱测量中应用

第3章 试适体修饰的纳米孔在单分子检测中的应用

第4章 嵌入生物膜的phi29噬菌体DNA组装马达对双链DNA易位和检测的研究

第5章 用于检测特异性DNA的固态纳米孔

第6章 固态纳米孔在蛋白质单分子检测中的应用

第7章 基于半导体材料的固态纳米孔的易位电信号模拟

第8章 固态纳米孔的制备,集成及DNA检测的可行性

第9章 纳米孔在蛋白质活性检测中的应用

第10章 核酸在5nm以下固态纳米孔的捕获和易位过程

第11章 基于纳米孔的DNA测序和DNA行为控制

第12章 基于纳米孔的第三代DNA测序技术

第13章 生物通道在恐怖战剂和生物分子检测中的应用

第14章 纳米孔力谱:分子动力学模拟

索引

图版

前言/序言


新生物学丛书·单细胞测序技术:原理、应用与挑战 图书简介 在当代生命科学研究的宏大图景中,单细胞技术无疑是最引人注目的前沿领域之一。本书《新生物学丛书·单细胞测序技术:原理、应用与挑战》,聚焦于单细胞测序(Single-Cell Sequencing, SCS)技术的深度剖析、实际应用案例的系统梳理,以及未来发展中亟待解决的关键挑战。本书旨在为生命科学、生物信息学、医学研究人员以及相关领域的高年级本科生和研究生提供一本全面、深入且具有实践指导意义的参考读物。 第一部分:单细胞测序技术的基础与原理 本部分首先构建了理解单细胞测序技术所需的理论基石。我们回顾了传统群体测序(Bulk Sequencing)方法的局限性,明确了从群体平均走向细胞异质性研究的时代必然性。 第一章:异质性的时代召唤与技术演进 详细阐述了生物体内细胞异质性的生物学意义,从发育生物学中的细胞命运决定到病理生理学中的肿瘤微环境复杂性。随后,本书概述了单细胞分析技术从早期的荧光原位杂交(FISH)到流式细胞术(FACS)分选,再到高通量测序技术整合的完整发展脉络。重点解析了实现单细胞分辨率测序所必须克服的两个核心技术瓶颈:单细胞捕获和高灵敏度扩增。 第二章:核心技术平台详解 这是本书技术核心部分。我们对目前主流的单细胞测序平台进行了细致的剖析和对比: 微流控液滴系统(Microfluidic Droplet-based Systems): 深入讲解了以10x Genomics Chromium平台为代表的微乳液液滴技术,包括油包水乳液的生成、单个细胞和分子捕获的机制、Barcode(细胞标签)和UMI(唯一分子标识符)的引入原理及其在校正PCR扩增偏差中的关键作用。 基于孔板/纳升级孔阵列系统(Well-based/Pico-liter Well Systems): 探讨了如Drop-seq和Seq-well等平台的原理,侧重于其在处理大规模样本和高通量筛选中的优势与局限。 基于分选的单细胞测序(Cell Sorting-based SCS): 讨论了通过FACS或微孔捕获后的文库构建流程,强调了该方法在获取高质量转录组数据方面的潜力,以及其对细胞活力的要求。 第三章:不同组学维度的单细胞测序 单细胞测序的应用已远超转录组学范畴。本章系统介绍了多组学单细胞分析的原理和挑战: 单细胞转录组测序(scRNA-seq): 聚焦于首次转录本捕获(C1-prime)、反转录效率、线粒体RNA比例的解读,以及对稀有细胞群体的鉴定。 单细胞表观遗传学(scATAC-seq): 阐述了如何通过Tn5转座酶在单细胞水平上标记开放染色质区域,揭示基因调控元件的活性状态。 单细胞蛋白质组学与多组学整合: 介绍了CITE-seq、REAP-seq等平台如何同时测量mRNA和细胞表面蛋白,以及Cell Hashing技术在克服批次效应中的应用。 第二部分:单细胞测序数据的分析与解读 单细胞测序产生了海量、稀疏且高噪声的数据,如何从中提取可靠的生物学信息是关键。 第四章:数据预处理与质量控制(QC) 本章侧重于实践操作和质量评估。详细介绍了识别低质量细胞、去除线粒体基因、数据归一化(如SCTransform方法)以及批次效应矫正的常用算法。强调了技术噪声与生物学变异的区分标准。 第五章:降维、聚类与细胞类型鉴定 这是单细胞分析的核心步骤。我们深入探讨了主流降维算法(如PCA、t-SNE、UMAP)的数学基础及其在可视化中的差异。详细阐述了基于图论的聚类算法(如Louvain、Leiden)的迭代过程,并介绍了如何利用参考基因集(如CellMarker、PanglaoDB)对发现的簇进行生物学注释。 第六章:轨迹推断与细胞状态转换 对于研究动态过程(如分化、疾病进展)的数据,轨迹推断是必不可少的工具。本章比较了基于图(如PAGA)和基于潜在空间(如Monocle 3)的算法,重点分析了如何通过伪时间(Pseudotime)分析来重建细胞命运决定路径,以及如何识别关键的调控节点。 第七章:差异分析与功能富集 如何从聚类结果中找到区分不同细胞群的标志物基因(Marker Genes)?本章讲解了统计检验方法(如Wilcoxon Rank-Sum Test、MAST模型)。同时,介绍了如何利用这些差异基因进行通路富集分析(GSEA),从而理解不同细胞亚群在分子功能上的特异性。 第三部分:单细胞测序的应用前沿与挑战 本部分将理论和方法应用于具体的生物医学场景,并展望未来的技术趋势。 第八章:单细胞测序在疾病研究中的突破 深入剖析了scRNA-seq如何重塑我们对以下领域的认知: 肿瘤免疫微环境: 鉴定肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)和免疫抑制性T细胞克隆的异质性。 神经科学: 绘制大脑发育中的细胞图谱,解析特定脑区神经元亚型的形成机制。 自身免疫性疾病: 揭示炎症反应中免疫细胞的激活和分化状态。 第九章:空间组学与单细胞技术的融合 单细胞测序提供了细胞的身份信息,但丢失了空间位置。本章重点介绍了空间转录组学(Spatial Transcriptomics)技术,如Visium和MERFISH,并阐述了如何通过计算方法将单细胞数据投射回组织切片,实现“有身份、有位置”的完整解析。 第十章:未来的方向与未解决的难题 本书最后探讨了单细胞技术仍面临的关键限制: 捕获效率与稀有细胞: 如何在保证高通量的同时,提高对稀有细胞(如干细胞、循环肿瘤细胞)的捕获率。 技术成本与标准化: 降低测序和数据分析的门槛,建立行业统一的实验和分析标准。 动态时间分辨率的提升: 发展更高时间分辨率的技术,以捕捉转录状态的瞬时变化。 结语 《单细胞测序技术:原理、应用与挑战》不仅是技术手册,更是研究方法的指南。通过扎实的原理介绍、详尽的案例分析和对前沿挑战的批判性思考,本书期望能激励研究者们充分利用单细胞技术的力量,推动生命科学向更精细、更精准的领域迈进。

用户评价

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这本书的标题《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》让我想起了我学生时代对分子生物学的好奇心,那时候我们只能依靠一些比较间接的方法来推测分子之间的关系,而现在,竟然可以通过一个微小的“孔”来直接“看”到它们是怎么相互作用的,这简直是颠覆性的。我一直觉得,生命的本质就是各种分子在不停地交流和互动,理解了这些互动,就能理解生命为什么会这样运作,为什么会生病,以及如何去治疗。纳米孔这个概念听起来就充满了科技感,像是科幻电影里的情节,但这本书把它带入了现实,而且还聚焦在“传感”这一核心功能上,这让我非常好奇。我想知道,到底是什么样的物理或化学原理,让一个微小的纳米孔能够如此灵敏地捕捉到分子相互作用的细微变化?这本书会不会深入讲解纳米孔的结构设计,比如孔的尺寸、形状、材料的选择,以及这些因素如何影响传感的灵敏度和特异性?我期待它能展示一些实际的传感案例,比如利用纳米孔技术检测DNA突变,或者分析蛋白质构象的变化,让我能更直观地感受到这项技术的力量。

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这本《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》的封面设计,我第一眼看到就觉得非常有科技感,深邃的蓝色背景,中间一个抽象的纳米孔结构,闪烁着微光,仿佛蕴含着无限的奥秘。我平时对生物学和前沿科技都挺感兴趣的,尤其是纳米技术在生物领域的应用,一直是我关注的焦点。一直以来,我都觉得生物分子的相互作用是生命活动最根本的体现,理解了这些相互作用,就能更深入地揭示生命的奥秘,甚至为疾病的诊断和治疗提供新的思路。这本书的书名直接点出了“纳米孔”和“生物分子相互作用传感”,这正是我一直以来渴望了解和学习的领域。我一直好奇,如何通过纳米孔这样微小的通道来“窥探”分子之间的细微变化?这种技术究竟能达到怎样的精度?它又有哪些实际的应用前景?这本书的出现,就像一盏指路明灯,让我看到了通往这些答案的路径。我迫不及待地想翻开它,去探索纳米孔的奇妙世界,了解它是如何实现对生物分子相互作用的精准捕捉和分析的。我坚信,这本书会为我打开一扇全新的视角,让我对生命科学的认识提升到一个新的高度,或许还能激发我未来在这个领域进行深入研究的兴趣。

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作为一名生物信息学领域的从业者,我深知数据在现代生物学研究中的重要性,而高质量的数据来源是关键。最近听闻纳米孔测序技术在生物分子相互作用研究方面有着巨大的潜力,所以当看到这本《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》时,我眼前一亮。我更关注的是这本书在实际应用层面的价值。它是否会介绍如何利用纳米孔技术来捕获和分析那些难以通过传统方法研究的瞬时或微弱的分子相互作用?比如,研究蛋白质-核酸的动态结合过程,或者检测微量生物标志物的存在。这本书的名字“传感基础”让我期待它能提供一套扎实的理论框架,帮助我理解纳米孔传感器的工作机制,以及如何设计和优化实验来获取可靠的数据。我希望书中能够详细阐述信号的产生、传递和放大机制,以及如何区分背景噪声和真实信号。此外,对于数据分析和解释部分,我尤其感兴趣,它是否会提供一些算法或模型,来帮助研究人员从海量的纳米孔传感数据中提取有意义的信息?如果这本书能为我在实际科研工作中提供指导,那将是非常宝贵的。

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我一直对那些能够“看到”微观世界的科学技术非常着迷,尤其是当这些技术能够直接揭示生命活动最核心的秘密时。这本书的题目《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》深深地吸引了我,因为它结合了“纳米孔”这一前沿技术和“生物分子相互作用传感”这一核心的生命科学研究领域。我猜想,这本书应该会提供一个非常系统和深入的视角,来探讨如何利用纳米孔器件来实现对生物分子之间动态变化的实时监测。我尤其好奇的是,这本书会不会详细介绍不同类型的纳米孔传感平台,例如固态纳米孔、生物纳米孔等,以及它们各自的优缺点和适用范围。我期待它能够解释纳米孔传感的定量分析方法,包括如何校准传感器、如何解读输出信号,以及如何将这些信号转化为有意义的生物学信息。而且,如果书中能够提供一些关于纳米孔技术在疾病诊断、药物研发、基因组学等方面的应用案例,那将非常有说服力,也能让我更清晰地认识到这项技术未来的巨大潜力。

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最近手痒,想找点硬核的生物科技相关读物,偶然瞥见这本书的宣传,立刻被吸引了。我一直对那种“小即是美”的科学技术非常着迷,而纳米孔技术恰恰符合我的胃口。想象一下,一个比病毒还小的孔道,竟然能够检测和分析比它大得多的生物分子,这本身就充满了一种令人惊叹的工程之美。这本书的书名《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》让我觉得它应该会深入浅出地讲解纳米孔的原理,而不是停留在概念层面。我特别好奇的是,不同的纳米孔材料和结构,在传感性能上会有哪些差异?它们又是如何通过改变电信号、光学信号等来反映分子相互作用的?这本书的“基础”二字,也让我觉得它可能包含了许多入门级的知识,比如纳米孔的制备方法、信号采集和数据处理等,这对我这样一个想要从头开始了解这个领域的人来说,简直是福音。我希望它能详细介绍一些经典和前沿的纳米孔传感平台,以及它们在研究DNA、RNA、蛋白质等生物分子方面的成功案例,最好还能提供一些实验设计的思路或者数据解读的方法。

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《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》会为纳米孔领域的科研工作者和研究生提供极大的帮助和重要的参考价值。

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对专业很有帮助,希望能开启我的学术新方向。

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纳米孔检测技术的理论提出于20世纪末,被认为是能够首先解决单分子、非标记检测的重要技术之一。《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》围绕纳米孔技术这个主题,介绍了纳米孔结合生物标记检测技术,以及其用作基因组测序和疾病早期检测的最新研究进展。全书共分14章,分别邀请了国际上纳米孔研究领域起步最早、成果丰硕的研究小组的领军学者,从纳米孔技术研究的各个角度,如理论计算、实验体系、数据模拟和分析以及应用性检测等方面的发展历史、当前近况以及发展趋势等进行了介绍和总结。

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对专业很有帮助,希望能开启我的学术新方向。

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纳米孔检测技术的理论提出于20世纪末,被认为是能够首先解决单分子、非标记检测的重要技术之一。《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》围绕纳米孔技术这个主题,介绍了纳米孔结合生物标记检测技术,以及其用作基因组测序和疾病早期检测的最新研究进展。全书共分14章,分别邀请了国际上纳米孔研究领域起步最早、成果丰硕的研究小组的领军学者,从纳米孔技术研究的各个角度,如理论计算、实验体系、数据模拟和分析以及应用性检测等方面的发展历史、当前近况以及发展趋势等进行了介绍和总结。

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还不错吧。看了涨点知识

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纳米孔检测技术的理论提出于20世纪末,被认为是能够首先解决单分子、非标记检测的重要技术之一。《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》围绕纳米孔技术这个主题,介绍了纳米孔结合生物标记检测技术,以及其用作基因组测序和疾病早期检测的最新研究进展。全书共分14章,分别邀请了国际上纳米孔研究领域起步最早、成果丰硕的研究小组的领军学者,从纳米孔技术研究的各个角度,如理论计算、实验体系、数据模拟和分析以及应用性检测等方面的发展历史、当前近况以及发展趋势等进行了介绍和总结。

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《新生物学丛书·纳米孔:生物分子相互作用传感基础》会为纳米孔领域的科研工作者和研究生提供极大的帮助和重要的参考价值。

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